Jupyter Notebook의 파일에서 이미지를 표시하려면 어떻게해야합니까?

Bioython 모듈로 만든 일부 게놈 차트를 대화식으로 분석하는 방법으로 IPython 노트북 을 사용하고 싶습니다 GenomeDiagram. matplotlibIPython 노트북에서 그래프를 인라인으로 가져 오는 방법에 대한 광범위한 문서가 있지만 GenomeDiagram은 IPython에서 인라인 그래프로 지원되지 않는 ReportLab 툴킷을 사용합니다.

그러나이 문제를 해결하는 방법은 플롯 / 게놈 다이어그램을 파일에 작성한 다음 이미지를 인라인으로 열어서 다음과 같은 결과를 얻을 수 있다고 생각했습니다.

gd_diagram.write("test.png", "PNG")
display(file="test.png")

그러나이 작업을 수행하는 방법을 알 수 없거나 가능한지 알 수 없습니다. IPython에서 이미지를 열거 나 표시 할 수 있는지 아는 사람이 있습니까?

씨의 이 게시물은 다음을 수행 할 수 있습니다 :

from IPython.display import Image
Image(filename='test.png') 

( 공식 문서 )

루프 내에서 이런 식으로 이미지를 표시하려는 경우 이미지 생성자를 표시 메소드로 랩핑해야합니다.

from IPython.display import Image, display

listOfImageNames = ['/path/to/images/1.png',
                    '/path/to/images/2.png']

for imageName in listOfImageNames:
    display(Image(filename=imageName))

지금까지 게시 된 솔루션은 png 및 jpg에서만 작동합니다.

추가 라이브러리를 가져 오지 않고 더 쉽게 원하거나 애니메이션 또는 애니메이션되지 않은 GIF 파일을 Ipython Notebook에 표시하려는 경우. 표시하려는 위치를 마크 다운으로 변환하고이 멋진 짧은 핵을 사용하십시오!

![alt text](test.gif "Title")

.jpgJupyter 에서 이미지를 가져 와서 표시합니다 (Anaconda 환경에서 Python 2.7로 테스트).

from IPython.display import display
from PIL import Image


path="/path/to/image.jpg"
display(Image.open(path))

PIL을 설치해야 할 수도 있습니다

Anaconda에서 이것은 입력하여 수행됩니다.

conda install pillow

씨의 이 페이지는, 나는 제안을 위하지 않았다 때이 일을 발견 :

import PIL.Image
from cStringIO import StringIO
import IPython.display
import numpy as np
def showarray(a, fmt='png'):
    a = np.uint8(a)
    f = StringIO()
    PIL.Image.fromarray(a).save(f, fmt)
    IPython.display.display(IPython.display.Image(data=f.getvalue()))

마크 다운 섹션에서 HTML 코드를 사용할 수 있습니다 : 예 :

 <img src="https://www.tensorflow.org/images/colab_logo_32px.png" />

표준 numpy, matplotlib 및 PIL을 사용하는 더 깨끗한 Python3 버전입니다. URL에서 열기위한 답변을 병합합니다.

import matplotlib.pyplot as plt
from PIL import Image
import numpy as np

pil_im = Image.open('image.png') #Take jpg + png
## Uncomment to open from URL
#import requests
#r = requests.get('https://www.vegvesen.no/public/webkamera/kamera?id=131206')
#pil_im = Image.open(BytesIO(r.content))
im_array = np.asarray(pil_im)
plt.imshow(im_array)
plt.show()

많은 수의 이미지를 효율적으로 표시하려면 IPyPlot 패키지를 사용하는 것이 좋습니다

import ipyplot

ipyplot.plot_images(images_array, max_images=20, img_width=150)

이 패키지에는 대화식 탭 (각 레이블 / 클래스에 대한 별도의 탭)으로 이미지를 표시 할 수있는 다른 유용한 기능이 있습니다. 이는 모든 ML 분류 작업에 매우 유용합니다.

GenomeDiagramJupyter (iPython)와 함께 사용 하는 경우 이미지를 표시하는 가장 쉬운 방법은 GenomeDiagram을 PNG 이미지로 변환하는 것입니다. IPython.display.Image 객체를 사용하여 랩핑하여 노트북에 표시 할 수 있습니다.

from Bio.Graphics import GenomeDiagram
from Bio.SeqFeature import SeqFeature, FeatureLocation
from IPython.display import display, Image
gd_diagram = GenomeDiagram.Diagram("Test diagram")
gd_track_for_features = gd_diagram.new_track(1, name="Annotated Features")
gd_feature_set = gd_track_for_features.new_set()
gd_feature_set.add_feature(SeqFeature(FeatureLocation(25, 75), strand=+1))
gd_diagram.draw(format="linear", orientation="landscape", pagesize='A4',
                fragments=1, start=0, end=100)
Image(gd_diagram.write_to_string("PNG"))

[노트북 참조]