내 코드에는 선형 시스템을 구성하고 과도하게 결정하고 해결하려고하는 루프가 있습니다.
#pragma omp parallel for
for (int i = 0; i < n[0]+1; i++) {
for (int j = 0; j < n[1]+1; j++) {
for (int k = 0; k < n[2]+1; k++) {
arma::mat A(max_points, 2);
arma::mat y(max_points, 1);
// initialize A and y
arma::vec solution = solve(A,y);
}
}
}
때로는 프로그램이 무작위로 중단되거나 솔루션 벡터의 결과가 NaN입니다. 그리고 이렇게하면 :
arma::vec solution;
#pragma omp critical
{
solution = solve(weights*A,weights*y);
}
그러면 이러한 문제는 더 이상 발생하지 않는 것 같습니다.
중단되면 일부 스레드가 OpenMP 장벽에서 대기하고 있기 때문에 중단됩니다.
Thread 2 (Thread 0x7fe4325a5700 (LWP 39839)):
#0 0x00007fe44d3c2084 in gomp_team_barrier_wait_end () from /usr/lib64/gcc-4.9.2/lib64/gcc/x86_64-redhat-linux-gnu/4.9.2/libgomp.so.1
#1 0x00007fe44d3bf8c2 in gomp_thread_start () at ../.././libgomp/team.c:118
#2 0x0000003f64607851 in start_thread () from /lib64/libpthread.so.0
#3 0x0000003f642e890d in clone () from /lib64/libc.so.6
그리고 다른 스레드는 Armadillo 내부에 붙어 있습니다.
Thread 1 (Thread 0x7fe44afe2e60 (LWP 39800)):
#0 0x0000003ee541f748 in dscal_ () from /usr/lib64/libblas.so.3
#1 0x00007fe44c0d3666 in dlarfp_ () from /usr/lib64/atlas/liblapack.so.3
#2 0x00007fe44c058736 in dgelq2_ () from /usr/lib64/atlas/liblapack.so.3
#3 0x00007fe44c058ad9 in dgelqf_ () from /usr/lib64/atlas/liblapack.so.3
#4 0x00007fe44c059a32 in dgels_ () from /usr/lib64/atlas/liblapack.so.3
#5 0x00007fe44f09fb3d in bool arma::auxlib::solve_ud<double, arma::Glue<arma::Mat<double>, arma::Mat<double>, arma::glue_times> >(arma::Mat<double>&, arma::Mat<double>&, arma::Base<double, arma::Glue<arma::Mat<double>, arma::Mat<double>, arma::glue_times> > const&) () at /usr/include/armadillo_bits/lapack_wrapper.hpp:677
#6 0x00007fe44f0a0f87 in arma::Col<double>::Col<arma::Glue<arma::Glue<arma::Mat<double>, arma::Mat<double>, arma::glue_times>, arma::Glue<arma::Mat<double>, arma::Mat<double>, arma::glue_times>, arma::glue_solve> >(arma::Base<double, arma::Glue<arma::Glue<arma::Mat<double>, arma::Mat<double>, arma::glue_times>, arma::Glue<arma::Mat<double>, arma::Mat<double>, arma::glue_times>, arma::glue_solve> > const&) ()
at /usr/include/armadillo_bits/glue_solve_meat.hpp:39
stacktrace에서 알 수 있듯이 Armadillo의 내 버전은 아틀라스를 사용합니다. 그리고이 문서에 따르면 atlas는 스레드로부터 안전한 것처럼 보입니다 : ftp://lsec.cc.ac.cn/netlib/atlas/faq.html#tsafe
2015 년 9 월 11 일 업데이트
마침내 Vladimir F의 제안에 따라 더 많은 테스트를 실행할 시간이 생겼습니다.
ATLAS의 BLAS로 아르마딜로를 컴파일 할 때, 나는 여전히 멈춤과 NaN을 재현 할 수 있습니다. 중단되면 stacktrace에서 변경되는 유일한 것은 BLAS에 대한 호출입니다.
#0 0x0000003fa8054718 in ATL_dscal_xp1yp0aXbX@plt () from /usr/lib64/atlas/libatlas.so.3
#1 0x0000003fb05e7666 in dlarfp_ () from /usr/lib64/atlas/liblapack.so.3
#2 0x0000003fb0576a61 in dgeqr2_ () from /usr/lib64/atlas/liblapack.so.3
#3 0x0000003fb0576e06 in dgeqrf_ () from /usr/lib64/atlas/liblapack.so.3
#4 0x0000003fb056d7d1 in dgels_ () from /usr/lib64/atlas/liblapack.so.3
#5 0x00007ff8f3de4c34 in void arma::lapack::gels<double>(char*, int*, int*, int*, double*, int*, double*, int*, double*, int*, int*) () at /usr/include/armadillo_bits/lapack_wrapper.hpp:677
#6 0x00007ff8f3de1787 in bool arma::auxlib::solve_od<double, arma::Glue<arma::Mat<double>, arma::Mat<double>, arma::glue_times> >(arma::Mat<double>&, arma::Mat<double>&, arma::Base<double, arma::Glue<arma::Mat<double>, arma::Mat<double>, arma::glue_times> > const&) () at /usr/include/armadillo_bits/auxlib_meat.hpp:3434
ATLAS없이 컴파일하고 netlib BLAS 및 LAPACK으로 만 NaN을 재현 할 수 있었지만 중단되지 않았습니다.
두 경우 모두, 주변 solve()에 #pragmaOMP 것이 중요 나는 전혀 문제가 없다