install.packages("rJava")명령을 사용하여 rJava를 설치할 때 다음 오류가 발생합니다.

checking Java support in R... present:
interpreter : '/usr/bin/java'
archiver    : '/usr/bin/jar'
compiler    : '/usr/bin/javac'
header prep.: '/usr/bin/javah'
cpp flags   : '-I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include -I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include/linux'
java libs   : '-L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64/server -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64 -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../lib/amd64 -L -L/usr/java/packages/lib/amd64 -L/usr/lib64 -L/lib64 -L/lib -L/usr/lib -ljvm'
checking whether JNI programs can be compiled... yes
checking JNI data types... configure: error: One or more JNI types differ from the corresponding native type. You may need to use non-standard compiler flags or a different compiler in order to fix this.
ERROR: configuration failed for package ‘rJava’

Java JDK가 설치되어 있고 java -version다음을 반환합니다.

$ java -version
java version "1.6.0_20"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.6.0_20-b02)

오류를 검색 할 때 다른 사람들이 동일한 문제를 겪고 있지만 내가 한 "JRE뿐만 아니라 전체 JDK를 설치"하는 것 외에 다른 해결책을 찾지 못하는 것을 알 수 있습니다.

내가 읽은 또 다른 것은 sudo R CMD javareconf오류없이 아주 행복하게 실행 되는 실행 이었습니다 .

내 문제가 무엇인지 아이디어가 있습니까?

[[편집]] 이 문제가 발생한 지 몇 달이 지났습니다. 아래에 게시 한 답변에 설명 된대로 Java 경로를 편집하여 처음에이 문제를 해결했습니다. 최근에 새로운 Ubuntu 설치에서 동일한 문제가 발생했습니다. apt-get을 사용하여 rJava 패키지를 설치하라는 Dirk의 권장 사항을 시도했습니다. 완벽하게 작동했습니다. 처음에 내가 인식하지 못한 점은 Ubuntu apt-get 메소드를 사용하여 패키지를 설치하는 것이 R 내부에서 install.packages ()를 사용하여 동일한 패키지를로드하는 것과 근본적으로 다르다는 것입니다. Ubuntu 패키지는 내가 깨닫지 못하거나 감사하지 않은 몇 가지 문제를 해결합니다. .

하지 않을

apt-get install r-cran-rjava

더 쉬웠습니까? useR 에서 저에게 물었을 수도 있습니다 ! :)

내 문제는 내 JAVA_HOME환경 변수의 문제였습니다 . 예, 충격적입니다. 내 초기에 설정 PATH하고 JAVA_HOME다음과 같이 보았다 :

export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-6-sun
export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin

그리고 /jre이제 다음과 같이 추가 했습니다.

export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-6-sun/jre
export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin

Java의 모든 것이 제대로 작동하는 것처럼 보였지만 /jrerJava는 그렇지 않습니다. 이상한.

감사합니다-에 대한 귀하의 제안은 $JAVA_HOME저를 비슷한 해결책으로 안내합니다.

prompt$ unset JAVA_HOME

R을 호출하기 전에.

동일한 문제가 발생했으며 아래 명령을 실행 한 후에 작동했습니다.

export JAVA_LIBS="$JAVA_LIBS -ldl"
R CMD javareconf

http://www-01.ibm.com/support/knowledgecenter/SSPT3X_3.0.0/com.ibm.swg.im.infosphere.biginsights.install.doc/doc/install_install_r.html 에서 세부 사항을 참조하십시오 .

그것이 내가 작동하는 방법입니다.

Linux (Ubuntu 16.04)

sudo apt-get install default-jre
sudo apt-get install default-jdk
sudo R CMD javareconf

R에서 :

install.packages("rJava")

이것은 Ubuntu 12.04 및 R 버전 3.0에서 저에게 효과적이었습니다.

cd /usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.26/include

이것은 jni.h가있는 디렉토리입니다.

다음으로 다른 필수 헤더 파일에 대한 소프트 링크를 만듭니다 (아래 JAVA_CPPFLAGS 옵션에 둘 이상의 디렉토리를 포함하는 방법을 찾기에는 너무 게으름) :

sudo ln -s linux/jni_md.h .

드디어

sudo R CMD javareconf JAVA_CPPFLAGS=-I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.26/include

아래는 다른 게시물에 대한 내 답변 중 하나입니다- 오류 : 지금 설치된 패키지를로드 할 수 없습니다
(이 질문과도 관련이 있습니다).

Linux (Ubuntu) 사용자 : oracle-java (7/8)가 설치되어있는 경우. 이 위치에 /usr/lib/jvm있으며 sudo액세스가 필요합니다.

/etc/ld.so.conf.d/java.conf다음 항목을 사용 하여 파일 을 만듭니다 .

/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64
/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server

(Java 버전에 따라 java-8-oracle을 java-7-oracle로 대체하십시오)

그때:

sudo ldconfig

RStudio를 다시 시작한 다음 rJava 패키지를 설치합니다.

AMD64의 Gentoo에서 R을 실행합니다. R 2.12.0으로 업그레이드했습니다.

R 버전 2.12.0 (2010-10-15) Copyright (C) 2010 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 Platform : x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) and that 성가신 메시지는 떨어져.

얀 반더 미어

openjdk-7- *를 설치하려고했지만 여전히 rJava를 설치하는 데 문제가있었습니다. 컴퓨터를 다시 시작하면 아무 문제가 없었습니다.

그래서

sudo apt-get install openjdk-7-*


RESTART after installing java, then try to install package "rJava" in R

rJava 패키지는 /usr/lib/jvm/default-java/ 폴더를 . 그러나 기본적으로 사용할 수 없습니다. 이 폴더에는 시스템에 구성된 기본 Java에 대한 심볼릭 링크가 있습니다.

기본 Java를 활성화하려면 다음 패키지를 설치하십시오.

sudo apt-get install default-jre default-jre-headless

CRAN R 3.4.1로 우분투 17.04에서 테스트되었습니다.

나를 위해 일한 것은 JAVA_HOME을 파일에서 변경하는 것입니다. /usr/lib/R/etc/javaconf

먼저 Java 버전이 무엇인지 확인했습니다 sudo update-alternatives --config java. 제 경우에는java-8-oracle

파일을 열고 다음으로 /usr/lib/R/etc/javaconf대체 default-java했습니다 java-8-oracle.

${JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/default-java}

로 교체되다 :

${JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-8-oracle}

그리고 sudo R CMD javareconf

RStudio를 다시 시작한 다음 rJava를 설치할 수 있습니다.

내가하는 일은 여기 :

1. /etc/apt/sources.list에 다음을 추가하십시오.

   deb http://ftp.de.debian.org/debian sid main

참고 : rjava는 최신 버전이어야합니다.

2 실행 : sudo apt-get update sudo apt-get install r-cran-rjava

rjava의 이전 버전을 업데이트하면 rhdfs_1.0.8을 설치할 수 있습니다.

https://cran.r-project.org/src/contrib/rJava_0.9-8.tar.gz 를 다운로드 하고 R CMD install rJava_0.9-8.tar.gz 명령을 실행 하여 작동했습니다.

Windows 10을 사용하는 동안 동일한 문제가 발생했습니다. 다음 절차를 사용하여 문제를 해결했습니다.

1. https://java.com/en/download/windows-64bit.jsp 에서 64 비트 Windows 용 Java 다운로드 \ 설치
2. https://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk8-downloads-2133151.html 에서 64 비트 Windows 용 Java 개발 키트를 다운로드 \ 설치
3. 그런 다음 바탕 화면 \ 속성 \ 고급 시스템 설정 \ 고급 \ 환경 변수 \ 시스템 변수에서 "이 PC"아이콘을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭합니다. 경로 \ 편집 클릭 \ 새로 만들기 \ 복사를 클릭하고 경로 "C : \ Program Files \ Java \ jdk1 .8.0_201 \ bin "및"C : \ Program Files \ Java \ jre1.8.0_201 \ bin "(따옴표 제외) \ OK \ OK \ OK

참고 : jdk1.8.0_201 및 jre1.8.0_201은 Java 개발 키트 및 Java 버전에 따라 변경됩니다.

4. 환경 변수 창에서 사용자에 대한 사용자 변수로 이동 \ 새로 만들기 \ 변수 이름을 "JAVA_HOME"으로 입력하고 변수 값을 "C : \ Program Files \ Java \ jdk1.8.0_201 \ bin"으로 \ 확인을 누릅니다.

설치를 확인하려면 CMD \ Type javac \ Enter를 열고 java \ press Enter를 입력하십시오.

RStudio에서 실행

Sys.setenv(JAVA_HOME="C:\\Program Files\\Java\\jdk1.8.0_201")

참고 : jdk1.8.0_201은 Java 개발 키트 버전에 따라 변경됩니다.

이제 아무 문제없이 rJava 패키지를 설치하고로드 할 수 있습니다.

문제는 rJava가 RStudio( Version 1.0.136)에 설치되지 않는다는 것 입니다. 다음은 나를 위해 일했습니다 ( macOS Sierra version 10.12.6) ( 여기 에서 찾았 습니다 ).

1 단계 : 여기javaforosx.dmg 에서 다운로드 및 설치

2 단계 : 다음으로 RStudio 내부에서 명령을 실행합니다.

install.packages("rJava", type = 'source')

Ubuntu 16.04에서 유사한 문제가 발생했으며 "default-java"라는 폴더를 만들고 .NET Framework의 /usr/lib/jvm모든 내용을 복사 하여 해결할 수있었습니다 /usr/lib/jvm/java-8-oracle. JAVA_HOME 환경 변수를 수정하는 것이 쓸모없는 것으로 판명 되었으므로이 솔루션을 선택했습니다.