Keras, 각 레이어의 출력을 얻는 방법?


155

CNN을 사용하여 이진 분류 모델을 훈련했으며 여기에 내 코드가 있습니다.

model = Sequential()
model.add(Convolution2D(nb_filters, kernel_size[0], kernel_size[1],
                        border_mode='valid',
                        input_shape=input_shape))
model.add(Activation('relu'))
model.add(Convolution2D(nb_filters, kernel_size[0], kernel_size[1]))
model.add(Activation('relu'))
model.add(MaxPooling2D(pool_size=pool_size))
# (16, 16, 32)
model.add(Convolution2D(nb_filters*2, kernel_size[0], kernel_size[1]))
model.add(Activation('relu'))
model.add(Convolution2D(nb_filters*2, kernel_size[0], kernel_size[1]))
model.add(Activation('relu'))
model.add(MaxPooling2D(pool_size=pool_size))
# (8, 8, 64) = (2048)
model.add(Flatten())
model.add(Dense(1024))
model.add(Activation('relu'))
model.add(Dropout(0.5))
model.add(Dense(2))  # define a binary classification problem
model.add(Activation('softmax'))

model.compile(loss='categorical_crossentropy',
              optimizer='adadelta',
              metrics=['accuracy'])
model.fit(x_train, y_train,
          batch_size=batch_size,
          nb_epoch=nb_epoch,
          verbose=1,
          validation_data=(x_test, y_test))

그리고 여기에서는 TensorFlow와 같이 각 레이어의 출력을 얻고 싶습니다. 어떻게 할 수 있습니까?

답변:


182

다음을 사용하여 모든 레이어의 출력을 쉽게 얻을 수 있습니다. model.layers[index].output

모든 레이어에 다음을 사용하십시오.

from keras import backend as K

inp = model.input                                           # input placeholder
outputs = [layer.output for layer in model.layers]          # all layer outputs
functors = [K.function([inp, K.learning_phase()], [out]) for out in outputs]    # evaluation functions

# Testing
test = np.random.random(input_shape)[np.newaxis,...]
layer_outs = [func([test, 1.]) for func in functors]
print layer_outs

참고 : 드롭 아웃의 사용을 시뮬레이션 learning_phase으로 1.의 layer_outs다른 사용0.

편집 : (주석에 따라)

K.function ano / tensorflow 텐서 함수를 생성하여 나중에 입력이 주어진 기호 그래프에서 출력을 얻는 데 사용됩니다.

이제 K.learning_phase()교육 및 테스트 시간 동안 동작을 변경하기 위해 Dropout / Batchnomalization과 같은 많은 Keras 레이어가 입력으로 필요합니다.

따라서 코드에서 드롭 아웃 레이어를 제거하면 간단하게 사용할 수 있습니다.

from keras import backend as K

inp = model.input                                           # input placeholder
outputs = [layer.output for layer in model.layers]          # all layer outputs
functors = [K.function([inp], [out]) for out in outputs]    # evaluation functions

# Testing
test = np.random.random(input_shape)[np.newaxis,...]
layer_outs = [func([test]) for func in functors]
print layer_outs

편집 2 : 더 최적화

방금 이전의 대답이 각 기능 평가에서 데이터가 CPU-> GPU 메모리로 전송되고 텐서 계산이 하위 계층 오버 오버에 대해 수행되어야하므로 최적화되지 않았다는 것을 깨달았습니다.

대신 여러 기능이 필요하지 않고 단일 출력으로 모든 출력 목록을 제공하므로 훨씬 더 나은 방법입니다.

from keras import backend as K

inp = model.input                                           # input placeholder
outputs = [layer.output for layer in model.layers]          # all layer outputs
functor = K.function([inp, K.learning_phase()], outputs )   # evaluation function

# Testing
test = np.random.random(input_shape)[np.newaxis,...]
layer_outs = functor([test, 1.])
print layer_outs

2
선생님, 대답이 좋습니다. K.function([inp]+ [K.learning_phase()], [out])코드에서 무슨 의미입니까?
— GoingMyWay

훌륭한 답변 np.random.random(input_shape)[np.newaxis,...]은 다음과 같이 쓸 수도 있습니다np.random.random(input_shape)[np.newaxis,:]
— Tom

K.function은 무엇입니까? GPU (MPI?)에 어떻게 전달됩니까? 무대 뒤에서 무엇인가? CUDA와의 대화는 어떻습니까? 소스 코드는 어디에 있습니까?
— Stav Bodik

3
@StavBodik 모델은 사용 함수를 구축 예측 K.function 여기서 , 상기의 용도를 예측 루프를 예측 여기 . 배치 크기에 대한 루프 예측 (기본값은 32로 설정되지 않은 경우)이지만 GPU 메모리의 제약 조건을 완화합니다. 그래서 나는 왜 당신이 관찰하고 있는지 model.predict더 잘 모르겠습니다 .
— indraforyou

1
이것을 얻는 중 : InvalidArgumentError : S_input_39 : 0이 공급되고 페치됩니다. ... 아이디어가있는 사람?
— mathtick

138

에서 https://keras.io/getting-started/faq/#how-can-i-obtain-the-output-of-an-intermediate-layer

간단한 방법 중 하나는 원하는 레이어를 출력하는 새 모델을 만드는 것입니다.

from keras.models import Model

model = ...  # include here your original model

layer_name = 'my_layer'
intermediate_layer_model = Model(inputs=model.input,
                                 outputs=model.get_layer(layer_name).output)
intermediate_output = intermediate_layer_model.predict(data)

또는 특정 입력이 주어지면 특정 레이어의 출력을 반환하는 Keras 함수를 빌드 할 수 있습니다. 예를 들면 다음과 같습니다.

from keras import backend as K

# with a Sequential model
get_3rd_layer_output = K.function([model.layers[0].input],
                                  [model.layers[3].output])
layer_output = get_3rd_layer_output([x])[0]

내가 두 가지를 줄 수 있다면 ^,이 방법은 입력이 많을 때 훨씬 편리합니다.
— Dan Erez

위의 코드에서 꽤 분명하지만 내 이해를 다시 확인하기 위해 기존 모델에서 모델을 만든 후 (이미 훈련 된 것으로 가정) 새 모델에서 set_weights를 호출 할 필요가 없습니다. 그 맞습니까?
— JZ

것 사이의 차이는 layer_output = get_3rd_layer_output([X, 0])[0]하고 layer_output = get_3rd_layer_output([X, 1])[0]워드 프로세서 기차 모드와 테스트 모드 언급
— 제이슨

죄송합니다.이 모델의 기능이 정확히 무엇인지 설명해 주시겠습니까? 훈련해야합니까? 나는 그것에 대한 어떤 다이어그램도 상상할 수 없다. 다른 모델의 입력 레이어를 추가 한 다음 다른 모델의 임의의 중간 레이어를 출력으로 추가하고 입력을 공급합니까? 왜 원본 모델을 공급하지 않고 중개 계층에 직접 액세스 할 수 있습니까? 이 이상한 모델을 만드는 이유는 무엇입니까? 그리고 출력에 영향을 미치지 않습니까? 교육을 배우거나 요구하지 않습니까? 아니면 레이어가 원래 모델에서 사전 훈련 된 자체 가중치를 가져옵니다.
— PedroD

19

이 스레드의 모든 좋은 대답을 바탕으로 각 레이어의 출력을 가져 오기 위해 라이브러리를 작성했습니다. 모든 복잡성을 추상화하고 가능한 한 사용자 친화적으로 설계되었습니다.

https://github.com/philipperemy/keract

거의 모든 에지 케이스를 처리합니다.

그것이 도움이되기를 바랍니다!


8

다음은 나에게 매우 단순 해 보입니다.

model.layers[idx].output

위는 텐서 객체이므로 텐서 객체에 적용 할 수있는 작업을 사용하여 수정할 수 있습니다.

예를 들어, 모양을 얻으려면 model.layers[idx].output.get_shape()

idx 레이어의 색인이며 다음에서 찾을 수 있습니다. model.summary()


1
이 답변에 어떤 문제가 있습니까? 이것이 왜 정답으로 올라가지 않습니까?
— 블랙 잭 21

1
데이터 프레임이 아닌 텐서 객체를 반환합니다. tf 객체는 이상하게 작동합니다.
— HashRocketSyntax

7

나는 (Jpypyter에서) 나 자신을 위해이 기능을 작성했으며 영감을 얻었습니다. indraforyou 의 답변 . 모든 레이어 출력을 자동으로 플로팅합니다. 이미지는 1 개의 채널을 나타내는 (x, y, 1) 모양이어야합니다. plot_layer_outputs (...)를 호출하여 플로팅합니다.

%matplotlib inline
import matplotlib.pyplot as plt
from keras import backend as K

def get_layer_outputs():
    test_image = YOUR IMAGE GOES HERE!!!
    outputs    = [layer.output for layer in model.layers]          # all layer outputs
    comp_graph = [K.function([model.input]+ [K.learning_phase()], [output]) for output in outputs]  # evaluation functions

    # Testing
    layer_outputs_list = [op([test_image, 1.]) for op in comp_graph]
    layer_outputs = []

    for layer_output in layer_outputs_list:
        print(layer_output[0][0].shape, end='\n-------------------\n')
        layer_outputs.append(layer_output[0][0])

    return layer_outputs

def plot_layer_outputs(layer_number):    
    layer_outputs = get_layer_outputs()

    x_max = layer_outputs[layer_number].shape[0]
    y_max = layer_outputs[layer_number].shape[1]
    n     = layer_outputs[layer_number].shape[2]

    L = []
    for i in range(n):
        L.append(np.zeros((x_max, y_max)))

    for i in range(n):
        for x in range(x_max):
            for y in range(y_max):
                L[i][x][y] = layer_outputs[layer_number][x][y][i]


    for img in L:
        plt.figure()
        plt.imshow(img, interpolation='nearest')

모델에 여러 입력이있는 경우 어떻게합니까? 입력을 어떻게 지정합니까?
— 안토니오 세 스토

이 줄에서 : layer_outputs_list = [op ([test_image, 1.]). 1. 0이어야합니까? 1은 훈련을 의미하고 0은 테스트를 의미합니까? 그렇지 않습니까?
— Kongsea

이것은 나를 위해 작동하지 않습니다. 컬러 이미지를 사용했는데 오류가 발생했습니다. InvalidArgumentError : input_2 : 0이 공급되고 페치됩니다.
— Vaibhav K

5

보낸 사람 : https://github.com/philipperemy/keras-visualize-activations/blob/master/read_activations.py

import keras.backend as K

def get_activations(model, model_inputs, print_shape_only=False, layer_name=None):
    print('----- activations -----')
    activations = []
    inp = model.input

    model_multi_inputs_cond = True
    if not isinstance(inp, list):
        # only one input! let's wrap it in a list.
        inp = [inp]
        model_multi_inputs_cond = False

    outputs = [layer.output for layer in model.layers if
               layer.name == layer_name or layer_name is None]  # all layer outputs

    funcs = [K.function(inp + [K.learning_phase()], [out]) for out in outputs]  # evaluation functions

    if model_multi_inputs_cond:
        list_inputs = []
        list_inputs.extend(model_inputs)
        list_inputs.append(0.)
    else:
        list_inputs = [model_inputs, 0.]

    # Learning phase. 0 = Test mode (no dropout or batch normalization)
    # layer_outputs = [func([model_inputs, 0.])[0] for func in funcs]
    layer_outputs = [func(list_inputs)[0] for func in funcs]
    for layer_activations in layer_outputs:
        activations.append(layer_activations)
        if print_shape_only:
            print(layer_activations.shape)
        else:
            print(layer_activations)
    return activations

링크가 더 이상 사용되지 않습니다.
— Saeed


5

@mathtick의 의견에 언급 된 문제를 해결하기 위해 @indraforyou의 답변에 이것을 의견으로 추가하고 싶었지만 (응답이 충분하지는 않습니다.) 방지하기 위해 InvalidArgumentError: input_X:Y is both fed and fetched.예외를 간단히 라인 교체 outputs = [layer.output for layer in model.layers]에 outputs = [layer.output for layer in model.layers][1:], 즉

indraforyou의 최소 작업 예를 조정하십시오.

from keras import backend as K 
inp = model.input                                           # input placeholder
outputs = [layer.output for layer in model.layers][1:]        # all layer outputs except first (input) layer
functor = K.function([inp, K.learning_phase()], outputs )   # evaluation function

# Testing
test = np.random.random(input_shape)[np.newaxis,...]
layer_outs = functor([test, 1.])
print layer_outs

추신 시도 outputs = [layer.output for layer in model.layers[1:]]가 작동하지 않는 등의 시도 .


1
정확하지 않습니다. 입력 레이어가 첫 번째로 정의 된 경우에만 해당됩니다.
— Mpizos Dimitris

고마워요, 이것은 저에게 효과적이며 Mpizos의 의견에 따라 이유를 이해하고 싶습니다. 제 모델은 단지 3 개의 레이어 (단어 포함-BiLSTM-CRF)이므로 레이어 [0]을 제외해야했기 때문에 추측합니다. 퍼가기 만하고 활성화하지 않아야합니다.
— KMunro

@MpizosDimitris 예, 맞습니다. 그러나 @indraforyou (내가 수정하고 있음)가 제공 한 예에서 이것은 그렇습니다. @KMunro 내가 올바르게 이해한다면, 첫 번째 레이어의 출력에 신경 쓰지 않는 이유는 단순히 텐서 형태로 임베드 된 단어 인 단어 임베딩의 출력이기 때문입니다. keras모델 의 "네트워크"부분에 입력 ). 단어 포함 레이어는 여기에 제공된 예제의 입력 레이어와 같습니다.
— KamKam

3

당신이 있다고 가정 :

1- Keras 사전 훈련 model.

2- x이미지 또는 이미지 세트로 입력 하십시오. 이미지의 해상도는 입력 레이어의 치수와 호환되어야합니다. 예를 들어 3 채널 (RGB) 이미지의 경우 80 * 80 * 3 입니다.

3- layer활성화를 얻기위한 출력 이름 . 예를 들어 "flatten_2"레이어입니다. layer_names변수에 포함되어야하며 주어진 레이어의 이름을 나타냅니다 model.

4- batch_size는 선택적 인수입니다.

그런 다음 get_activation함수를 사용 layer하여 주어진 입력 x및 사전 훈련 된 출력 을 활성화 할 수 있습니다 model.

import six
import numpy as np
import keras.backend as k
from numpy import float32
def get_activations(x, model, layer, batch_size=128):
"""
Return the output of the specified layer for input `x`. `layer` is specified by layer index (between 0 and
`nb_layers - 1`) or by name. The number of layers can be determined by counting the results returned by
calling `layer_names`.
:param x: Input for computing the activations.
:type x: `np.ndarray`. Example: x.shape = (80, 80, 3)
:param model: pre-trained Keras model. Including weights.
:type model: keras.engine.sequential.Sequential. Example: model.input_shape = (None, 80, 80, 3)
:param layer: Layer for computing the activations
:type layer: `int` or `str`. Example: layer = 'flatten_2'
:param batch_size: Size of batches.
:type batch_size: `int`
:return: The output of `layer`, where the first dimension is the batch size corresponding to `x`.
:rtype: `np.ndarray`. Example: activations.shape = (1, 2000)
"""

    layer_names = [layer.name for layer in model.layers]
    if isinstance(layer, six.string_types):
        if layer not in layer_names:
            raise ValueError('Layer name %s is not part of the graph.' % layer)
        layer_name = layer
    elif isinstance(layer, int):
        if layer < 0 or layer >= len(layer_names):
            raise ValueError('Layer index %d is outside of range (0 to %d included).'
                             % (layer, len(layer_names) - 1))
        layer_name = layer_names[layer]
    else:
        raise TypeError('Layer must be of type `str` or `int`.')

    layer_output = model.get_layer(layer_name).output
    layer_input = model.input
    output_func = k.function([layer_input], [layer_output])

    # Apply preprocessing
    if x.shape == k.int_shape(model.input)[1:]:
        x_preproc = np.expand_dims(x, 0)
    else:
        x_preproc = x
    assert len(x_preproc.shape) == 4

    # Determine shape of expected output and prepare array
    output_shape = output_func([x_preproc[0][None, ...]])[0].shape
    activations = np.zeros((x_preproc.shape[0],) + output_shape[1:], dtype=float32)

    # Get activations with batching
    for batch_index in range(int(np.ceil(x_preproc.shape[0] / float(batch_size)))):
        begin, end = batch_index * batch_size, min((batch_index + 1) * batch_size, x_preproc.shape[0])
        activations[begin:end] = output_func([x_preproc[begin:end]])[0]

    return activations

2

다음 중 하나에 해당하는 경우 :

  • 오류: InvalidArgumentError: input_X:Y is both fed and fetched
  • 여러 입력의 경우

다음 변경을 수행해야합니다.

  • outputs변수의 입력 레이어에 필터 아웃 추가
  • functors루프에서 미세한 변화

최소 예 :

from keras.engine.input_layer import InputLayer
inp = model.input
outputs = [layer.output for layer in model.layers if not isinstance(layer, InputLayer)]
functors = [K.function(inp + [K.learning_phase()], [x]) for x in outputs]
layer_outputs = [fun([x1, x2, xn, 1]) for fun in functors]

무엇을 의미 [x1, x2, xn, 1]합니까? 내 x1이 정의되지 않았으며 여기에서 정의한 내용을 이해하고 싶습니다.
— HashRocketSyntax

@HashRocketSyntax x1및 x2모델의 입력입니다. 언급 한 바와 같이 모델에 2 개의 입력이있는 경우가 있습니다.
— Mpizos Dimitris

1

글쎄, 다른 답변은 매우 완전하지만, 모양을 "얻는"것이 아니라 "보는"기본적인 방법이 있습니다.

그냥하세요 model.summary(). 모든 레이어와 출력 모양을 인쇄합니다. "없음"값은 가변 차원을 나타내며 첫 번째 차원은 배치 크기입니다.


이것은 레이어가 아닌 레이어의 출력 (기본 레이어에 주어진 입력)에 관한 것입니다.
— mathtick
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