유전자 목록의 농축을 테스트하는 표준 실습은 초 지오메트리 테스트 또는 동일하게 일측 피셔의 정확한 테스트를 수행하는 것 입니다. 당신은 다음을 가지고 있습니다2 × 2 우발 사태 표 :
민감한민감하지 않음DNA 수리3874112다른232332435562703398
R
다음과 같이 테스트를 수행 할 수 있습니다 .
fisher.test(matrix(c(38,74,232,3324),nrow=2,ncol=2),alternative="greater")
매우 중요한 결과를 제공합니다.
Fisher's Exact Test for Count Data
data: matrix(c(38, 74, 232, 3324), nrow = 2, ncol = 2)
p-value < 2.2e-16
alternative hypothesis: true odds ratio is greater than 1
95 percent confidence interval:
5.062107 Inf
sample estimates:
odds ratio
7.34918
과다 표현 (과소 표현이 아닌)을 테스트 할 때 alternative
매개 변수는로 설정됩니다 "greater"
.