grep -f 예기치 않은 출력 생성

"grep -of file1.txt file2.txt"(아래 파일 내용)를 사용하여 출력을 얻습니다.

and
if
pineapple

'dif'와 'for'가없는 이유는 무엇입니까? 다른 스위치를 사용해야합니까?

file1.txt

and
dif
for
if
apple
pineapple

file2.txt

andiforpineapple

grep

— 나빈
소스

답변:

지정된 각 패턴에 대해 입력 파일을 다시 검색하려면 다음을 수행하십시오.

$ cat patterns.txt 
and
dif
for
if
apple
pineapple
$ cat source.txt 
andiforpineapple
$ while read; do grep -o -e"$REPLY" source.txt; done <patterns.txt
and
dif
for
if
apple
pineapple

그러나 소스 파일에 둘 이상의 행이있는 경우 원하는 출력 라인 순서와 다르게 표시됩니다. 당신이 이것을 사용하는 것을 말하지 않았기 때문에, 그것이 실제 문제에 효과가 있는지는 모르겠습니다.

— 프레드 Nurk
소스

안녕 프레드, My source.txt 파일에는 알려지지 않은 DNA 서열의 긴 단일 문자열이 포함되어 있으며 patterns.txt에는 알려진 작은 DNA 조각이 몇 개 포함되어 있습니다.

나는 쉘을 처음 접했으므로 그것을 분해하는 것은 당신의 종류 일 것입니다. 이것은 어떻게 작동합니까? 읽는 동안; grep -o -e "$ REPLY"를하십시오. source.txt; 완료 <patterns.txt

@Naveen : 나는 그런 종류의 DNA 매칭을 위해 다른 도구를 사용할 것입니다. while, read 및 <에 대한 도움말은 sh의 문서 (예 : man bash)에서 "help while", "help read"및 "redirection"섹션을 참조하십시오.

— Fred Nurk

@Fred : "저는 그런 종류의 DNA 매칭을 위해 다른 도구를 사용할 것입니다." 이런 종류의 작업에 어떤 도구가 사용됩니까?

이것이 어떻게 작동하는지 이해했습니다. 감사! "읽는 동안 grep -oe"$ REPLY "source.txt; done <patterns.txt"

이것처럼 :

andiforpineapple
  ^found and
   ^continuing search from i
    ^found if
     ^continuing search from o
       ^found pineapple

— 리차드 브라이트 웰
소스

안녕 리차드, 문자열의 처음부터 검색을 시작하는 방법이 있습니까?

grep에는 여러 가지 구현이 있습니다. 어느 것을 사용하고 있습니까?

— Richard Brightwell

나는 grep, GNU grep 2.6.3에이 버전을 사용하고 있으며이 os, Ubuntu 11.04

이에 대한 명령 줄 옵션이 표시되지 않고 불행히도 현재 Linux VM이 종료되었습니다. 정규식의 시작과 일치하도록 \ A 앵커를 사용하도록 정규식을 향상시키는 실험을하고 싶습니다. 시도해 볼 수 있습니다. 다음은 웹에서 좋은 참조 사이트입니다 .

— Richard Brightwell