나는 파이썬에 익숙하지 않고 juncBase에 의한 대안 스 플라이 싱 디스커버리를하고 싶지만 juncBase 매뉴얼의 첫 번째 단계에서 오류가 있습니다.
sabah@sabah-virtual-machine:~/juncBase/juncBASE_v0.6 $ python2.7 runCufflinks.py -i IlluminaHBM_2.0_samp2test_bam.txt --txt_ref UCSC.hg19.knownGene_w_gene_symbol_EnsemblChr.gtf --out_dir /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/out --num_processes 2
cufflinks -o /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/out/kidney_cufflinks -g UCSC.hg19.knownGene_w_gene_symbol_EnsemblChr.gtf -u kidney.bam
Traceback (most recent call last):
File "runCufflinks.py", line 242, in <module>
if __name__ == "__main__": main()
File "runCufflinks.py", line 201, in main
Popen(cmd, shell=True, executable=SHELL)
File "/usr/lib/python2.7/subprocess.py", line 710, in __init__
errread, errwrite)
File "/usr/lib/python2.7/subprocess.py", line 1335, in _execute_child
raise child_exception
OSError: [Errno 2] No such file or directory
도와 줄래? 내가 입력하면 python2.7 runCufflinks.py
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