배열을 두 번 정렬하지 않고 Python / NumPy를 사용하여 배열의 항목 순위 지정


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숫자 배열이 있고 첫 번째 배열에서 각 항목의 순위를 나타내는 또 다른 배열을 만들고 싶습니다. 저는 Python과 NumPy를 사용하고 있습니다.

예를 들면 :

array = [4,2,7,1]
ranks = [2,1,3,0]

내가 생각 해낸 가장 좋은 방법은 다음과 같습니다.

array = numpy.array([4,2,7,1])
temp = array.argsort()
ranks = numpy.arange(len(array))[temp.argsort()]

배열을 두 번 정렬하지 않는 더 좋고 빠른 방법이 있습니까?


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마지막 줄은 ranks = temp.argsort().
Sven Marnach 2011 년

답변:


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마지막 단계에서 왼쪽에 슬라이싱을 사용합니다.

array = numpy.array([4,2,7,1])
temp = array.argsort()
ranks = numpy.empty_like(temp)
ranks[temp] = numpy.arange(len(array))

이렇게하면 마지막 단계에서 순열을 반전하여 두 번 정렬하는 것을 방지 할 수 있습니다.


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완벽합니다, 감사합니다! 나는 해결책이 있다는 것을 알았고 그것을 본 후에는 분명해 보일 것입니다. timeit으로 몇 가지 테스트를 수행했으며이 방법은 작은 배열의 경우 약간 느립니다. 내 컴퓨터에서는 배열에 2,000 개의 요소가있을 때 동일합니다. 20,000 개 요소에서 분석법이 약 25 % 더 빠릅니다.
joshayers 2011 년

행 방식으로 수행하는 방법에 대한 권장 사항이 있습니까?
Xaser

1 개 이상의 희미한 경우 아래 답변을 참조하십시오.
mathtick

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argsort를 두 번 사용하여 먼저 배열의 순서를 얻은 다음 순위를 얻습니다.

array = numpy.array([4,2,7,1])
order = array.argsort()
ranks = order.argsort()

2D (또는 더 높은 차원의) 배열을 다룰 때 올바른 축에 대해 정렬하기 위해 축 인수를 argsort에 전달해야합니다.


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입력 배열에서 숫자가 반복되는 경우 (예 [4,2,7,1,1][3,2,4,0,1]
:)

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두 번 정렬하는 것은 비효율적입니다. @Sven Marnach의 답변은 단일 호출로 순위를 달성하는 방법을 보여줍니다 argsort.
Warren Weckesser 2015-07-13

6
@WarrenWeckesser : 방금이 둘의 차이를 테스트했는데 큰 배열에 적합하지만 더 작은 배열 (n <100)의 경우 double argsort가 더 빠릅니다 (n = 100의 경우 약 20 %, 약 5 배 더 빠름). n = 10 인 경우). 따라서 많은 작은 값 집합에 대해 많은 순위를 지정해야하는 경우이 방법이 훨씬 좋습니다.
naught101 aug.

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@WarrenWeckesser : 사실, 제가 틀렸어요.이 방법은 손을 대지 않는 것이 좋습니다. 두 방법 모두 scipy.stats 방법보다 훨씬 빠릅니다. 결과 : gist.github.com/naught101/14042d91a2d0f18a6ae4
naught101

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@ naught101 : 스크립트에 버그가 있습니다. 줄 array = np.random.rand(10)array = np.random.rand(n).
Warren Weckesser

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이 질문은 몇 년 전이고 받아 들여지는 대답은 훌륭하지만 다음은 여전히 ​​언급 할 가치가 있다고 생각합니다. 에 대한 종속성이 마음에 들지 않으면 scipy다음을 사용할 수 있습니다 scipy.stats.rankdata.

In [22]: from scipy.stats import rankdata

In [23]: a = [4, 2, 7, 1]

In [24]: rankdata(a)
Out[24]: array([ 3.,  2.,  4.,  1.])

In [25]: (rankdata(a) - 1).astype(int)
Out[25]: array([2, 1, 3, 0])

의 좋은 기능은 인수가 관계를 처리하기위한 몇 가지 옵션을 제공 rankdata한다는 것 method입니다. 예를 들어,에 20이 세 번 발생하고 40이 두 번 발생합니다 b.

In [26]: b = [40, 20, 70, 10, 20, 50, 30, 40, 20]

기본값은 평균 순위를 동일한 값에 할당합니다.

In [27]: rankdata(b)
Out[27]: array([ 6.5,  3. ,  9. ,  1. ,  3. ,  8. ,  5. ,  6.5,  3. ])

method='ordinal' 연속 순위를 할당합니다.

In [28]: rankdata(b, method='ordinal')
Out[28]: array([6, 2, 9, 1, 3, 8, 5, 7, 4])

method='min' 모든 동률 값에 동률 값의 최소 순위를 할당합니다.

In [29]: rankdata(b, method='min')
Out[29]: array([6, 2, 9, 1, 2, 8, 5, 6, 2])

추가 옵션은 독 스트링을 참조하십시오.


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예, 이것은 엣지 케이스가 중요한 모든 곳에서 가장 좋은 답변입니다.
naught101

rankdata내부적으로 초기 순위를 생성하기 위해 허용 된 답변과 동일한 메커니즘을 사용 하는 것으로 보이는 것이 흥미 롭습니다 .
AlexV

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두 개 이상의 차원 배열 A에 대해 두 솔루션을 모두 확장하려고 시도했으며 배열을 행 단위로 처리한다고 가정합니다 (axis = 1).

행에 대한 루프로 첫 번째 코드를 확장했습니다. 아마도 그것은 개선 될 수 있습니다

temp = A.argsort(axis=1)
rank = np.empty_like(temp)
rangeA = np.arange(temp.shape[1])
for iRow in xrange(temp.shape[0]): 
    rank[iRow, temp[iRow,:]] = rangeA

그리고 k.rooijers의 제안에 따라 두 번째는 다음과 같습니다.

temp = A.argsort(axis=1)
rank = temp.argsort(axis=1)

모양 (1000,100)을 가진 400 개의 배열을 무작위로 생성했습니다. 첫 번째 코드는 약 7.5, 두 번째 코드는 3.8이었습니다.


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평균 순위의 벡터화 된 버전은 아래를 참조하십시오. 나는 np.unique를 좋아한다. 그것은 코드가 효율적으로 벡터화 될 수있는 것과 불가능한 것의 범위를 정말로 넓혀 준다. 파이썬 for 루프를 피하는 것 외에도이 접근 방식은 'a'에 대한 암시 적 이중 루프를 방지합니다.

import numpy as np

a = np.array( [4,1,6,8,4,1,6])

a = np.array([4,2,7,2,1])
rank = a.argsort().argsort()

unique, inverse = np.unique(a, return_inverse = True)

unique_rank_sum = np.zeros_like(unique)
np.add.at(unique_rank_sum, inverse, rank)
unique_count = np.zeros_like(unique)
np.add.at(unique_count, inverse, 1)

unique_rank_mean = unique_rank_sum.astype(np.float) / unique_count

rank_mean = unique_rank_mean[inverse]

print rank_mean

그건 그렇고; 다른 평균 순위 코드와 동일한 출력을 생성하도록이 코드를 만들었지 만 반복되는 숫자 그룹의 최소 순위도 똑같이 작동한다고 상상할 수 있습니다. >>> unique, index, inverse = np.unique (a, True, True) >>> rank_min = rank [index] [inverse]
Eelco Hoogendoorn

AttributeError : 나는 당신의 솔루션 (NumPy와 1.7.1)에 다음과 같은 오류를 얻고있다 'numpy.ufunc'객체 '에서'어떤 속성이 없습니다
두려움

이를 위해서는 최신 버전의 numpy가 필요합니다. 당신은 아주 고대이다
Eelco Hoogendoorn

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우아함과 솔루션의 부족 외에도 성능 문제도 있습니다. 다음은 약간의 벤치 마크입니다.

import numpy as np
from scipy.stats import rankdata
l = list(reversed(range(1000)))

%%timeit -n10000 -r5
x = (rankdata(l) - 1).astype(int)
>>> 128 µs ± 2.72 µs per loop (mean ± std. dev. of 5 runs, 10000 loops each)

%%timeit -n10000 -r5
a = np.array(l)
r = a.argsort().argsort()
>>> 69.1 µs ± 464 ns per loop (mean ± std. dev. of 5 runs, 10000 loops each)

%%timeit -n10000 -r5
a = np.array(l)
temp = a.argsort()
r = np.empty_like(temp)
r[temp] = np.arange(len(a))
>>> 63.7 µs ± 1.27 µs per loop (mean ± std. dev. of 5 runs, 10000 loops each)

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좋은 생각이지만 공정한 비교를 위해 rankdata(l, method='ordinal') - 1.
Warren Weckesser

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argsort ()를 두 번 사용하면됩니다.

>>> array = [4,2,7,1]
>>> ranks = numpy.array(array).argsort().argsort()
>>> ranks
array([2, 1, 3, 0])

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이것은 한 이미 언급 당신이 당신의 대답을 제기하기 전에 길을
치프 리안 Tomoiagă을

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위의 방법을 시도했지만 zeores가 많아 실패했습니다. 예, 수레를 사용하더라도 중복 항목이 중요 할 수 있습니다.

그래서 나는 타이 체크 단계를 추가하여 수정 된 1D 솔루션을 작성했습니다.

def ranks (v):
    import numpy as np
    t = np.argsort(v)
    r = np.empty(len(v),int)
    r[t] = np.arange(len(v))
    for i in xrange(1, len(r)):
        if v[t[i]] <= v[t[i-1]]: r[t[i]] = r[t[i-1]]
    return r

# test it
print sorted(zip(ranks(v), v))

가능한 한 효율적이라고 생각합니다.


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나는 k.rooijers의 방법을 좋아했지만 rcoup이 쓴 것처럼 반복되는 숫자는 배열 위치에 따라 순위가 매겨집니다. 이것은 나에게 좋지 않았으므로 순위를 후 처리하고 반복되는 숫자를 결합 된 평균 순위로 병합하도록 버전을 수정했습니다.

import numpy as np
a = np.array([4,2,7,2,1])
r = np.array(a.argsort().argsort(), dtype=float)
f = a==a
for i in xrange(len(a)):
   if not f[i]: continue
   s = a == a[i]
   ls = np.sum(s)
   if ls > 1:
      tr = np.sum(r[s])
      r[s] = float(tr)/ls
   f[s] = False

print r  # array([ 3. ,  1.5,  4. ,  1.5,  0. ])

나는 이것이 다른 사람들에게도 도움이되기를 바랍니다. 나는 이것에 대한 다른 해결책을 찾으려고했지만 아무것도 찾을 수 없었습니다.


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argsort와 slice는 대칭 연산입니다.

argsort 대신 두 번 슬라이스를 시도하십시오. 슬라이스가 argsort보다 빠르기 때문에

array = numpy.array([4,2,7,1])
order = array.argsort()
ranks = np.arange(array.shape[0])[order][order]

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