R에서 제로 팽창 된 음 이항 혼합 효과 모델


17

R에서 0으로 팽창 된 음 이항 혼합 효과 모델 추정을 제공하는 패키지가 있습니까?

그 말은 :

  • pscl 패키지의 zeroinfl 함수에서와 같이 제로 인플레이션에 대한 이항 모델을 지정할 수있는 제로 인플레이션 :

    zeroinfl (y ~ X | Z, dist = "네 그빈")
    여기서 Z는 제로 인플레이션 모델의 공식입니다.

  • 모형의 카운트 부분에 대한 음 이항 분포;

  • 패키지 lme4의 함수 lmer와 유사하게 지정된 임의의 효과.

나는 glmmADMB이 제로 인플레이션 공식을 지정할 수 없다는 것을 제외하고 모든 것을 할 수 있음을 이해합니다 (단지 가로 채기, 즉 Z는 단지 1입니다). 그러나 모든 것을 할 수있는 다른 패키지가 있습니까?

도와 주셔서 감사합니다!


나는 똑같은 것을 찾고 있습니다. glmmADMB가 내가 원하는 것으로 생각하지만 실행할 수는 없습니다.
gregmacfarlane

ZIM 또는 aod 패키지가 원하는 작업을 수행 할 수 있는지 궁금합니다 .
Graeme Walsh

2
업데이트 로 Ben Bolker 의 glmmTMB 패키지 는 ZIGLMM ( zero-inflated generalized linear mixed model)을 지원합니다.
JWilliman

답변:


5

나는 이것이 당신이 필요로하는 패키지라고 생각합니다 : glmmADMB. 여기에 다운로드했습니다 : http://otter-rsch.com/admbre/examples/glmmadmb/glmmADMB.html

그러나 여전히 실행하는 데 문제가 있었 으므로이 링크에 제공된 지침을 따르고 이제는 http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/에서 잘 작동합니다.

도움이 되었기를 바랍니다!


이 패키지는 모형의 무 인플레이션 부분에 상수 항을 피팅하는 것만 허용합니다.
user2390246 2016

1

PSCL의 패키지는 제로 팽창 포아송 모델을 제공합니다. 부정적인 이항 모델을 할 수 있다고 생각하지는 않지만 시작하는 곳 일 수 있습니다. 링크 된 JSS 기사에는 관련 패키지가 포함되어 있으며 원하는 패키지로 연결될 수 있습니다.


1
pscl 패키지는 다음을 사용하여 음 이항 모델을 허용합니다 (현재)zeroinfl(..., dist = "negbin", ...)
user2390246

0

수행하려는 작업에 따라 애 스터 패키지 를 볼 수 있습니다 . Aster 모델을 사용하면 확률 분포가 다른 여러 변수를 공동으로 분석 할 수 있으며 최근에 임의의 효과 를 허용하도록 업데이트되었습니다 . 수명 기록 분석을 위해 설계되었으며 응답을 다른 분포 (예 : 생존 = 베르누이, 생식 = 푸 아송)로 다른 부분으로 나눌 수있는 상황에서 작동합니다. 그들은 대부분의 0을 베르누이 (bernoulli)로, 나머지 반응은 음의 이항으로 모델링하여 "제로 인플레이션"을 처리 할 수 ​​있습니다.

당신은 여기에 많은 문서를 찾을 수 있습니다 :

http://www.stat.umn.edu/geyer/aster/

당사 사이트를 사용함과 동시에 당사의 쿠키 정책개인정보 보호정책을 읽고 이해하였음을 인정하는 것으로 간주합니다.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.