«computational-biology» 태그된 질문

저의 배경은 유전체학이지만 최근 단백질 구조와 관련된 문제를 다루고 있습니다. C로 몇 가지 관련 프로그램을 작성하여 프로세스에서 처음부터 내 PDB 파일 파서를 작성했습니다. 나는 정말로 강력한 파서를 만드는 것에 대해 걱정하지 않았다. 나는 스스로 하나를 만드는 것이 PDB 형식을 실제로 이해하도록하는 가장 좋은 방법이라는 것을 알았다. 이제이 과정을 거쳤으므로 좀 …

17 computational-biology  pdb  c 

저는 수학적 생물학 / 역학 분야에서 상당히 많이 일하고 있습니다. 대부분의 모델링 / 계산 과학 연구는 여전히 ODE 세트에 의해 지배되고 있으며, 때로는 상당히 정교한 ODE 세트가 있습니다. 이 모델의 장점 중 하나는 설명하고 복제하기가 쉽다는 것입니다. 매개 변수 값과 방정식 자체에 대한 표를 제공하며, 연구 수행에 필요한 방식으로 연구를 …

14 ode  computational-biology 

다른 생리적 과정이 일어나는 조직 층의 생물학적으로 정확한 2D 공간 모델을 만들려고 노력했습니다. 여기에는 주로 화학 반응, 확산 및 경계에서의 플럭스가 포함됩니다. 반응 확산 시스템과 같은 다른 물리학을 해결하는 유한 요소 소프트웨어 패키지 인 COMSOL Multiphysics에서이 모델을 만들고 있습니다. 내 기하학에는 조직 층의 세포 사이에 아주 작은 영역이 있습니다. 이들 …

10 finite-element  comsol  computational-biology 

나는 일반적인 미분 방정식-7 개의 방정식과 질병 전염의 수학적 모델의 일부로 그들의 행동을 지배하는 ~ 30 개의 매개 변수를 가지고 있습니다. 나는 것 같은 변경하는 식의 정상 상태를 찾을 수 dx/dt = rest of the equation에 0 = equation방정식의 각이 간단한 대수 문제하게합니다. 이것은 손으로 할 수 있지만, 나는 그런 …

9 ode  symbolic-computation  computational-biology