누군가가 선형 대 비선형 혼합 효과에 빛을 비출 수 있습니까?


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나는 R을 배우려고하고 있고 나의 학습 프로젝트는 예측 방정식을 개발하기 위해 혼합 또는 랜덤 효과 회귀를 데이터 세트에 적용하는 것을 수반 할 것이다. 이 글에서 작가의 관심사를 공유합니다 혼합 효과 모델을 위해 nlme 또는 lme4 R 라이브러리를 선택하는 방법은 무엇입니까? NLME 또는 LME4가 자신에게 익숙한 더 좋은 패키지인지 궁금합니다. 보다 기본적인 질문은 선형 및 비선형 혼합 효과 모델링의 차이점은 무엇입니까?

배경은 MS 연구 (MA가 아닌 MATLAB)에서 ME 모델링을 적용했기 때문에 고정 변수와 임의 변수가 어떻게 처리되는지 잘 알고 있습니다. 그러나 내가 한 작업이 선형 또는 비선형 ME로 간주되는지 확실하지 않습니다. 그것은 단순히 방정식의 기능적 형태입니까, 아니면 다른 것입니까?


필요한 경우 MS 논문에서 수행 한 작업에 대해서도 자세히 설명 할 수 있습니다.
Kevin

답변:


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선형 회귀 모델과 비선형 회귀 모델에는 몇 가지 차이점이 있지만, 주된 수학적 모델은 선형 모델이 매개 변수에서 선형 인 반면 비선형 모델은 매개 변수에서 비선형이라는 것입니다. nlmeR 패키지의 저자 인 Pinheiro와 Bates (2000, pp. 284-285) 는 모델 선택에서보다 실질적인 고려 사항을 우아하게 설명했습니다.

반응 변수가 공변량에 따라 어떻게 다른지 설명하기 위해 회귀 모델을 선택할 때 항상 다항식 모델과 같이 모수에서 선형 인 모델을 사용할 수 있습니다. 다항식 모델의 차수를 늘리면 관측 된 데이터 범위 내에서 일반적으로 비선형 회귀 함수에 대한 정확한 근사치를 점점 더 정확하게 얻을 수 있습니다. 이러한 경험적 모델은 반응과 공변량 간의 관측 된 관계에만 기반하며 데이터를 생성하는 기본 메커니즘에 대한 이론적 고려 사항은 포함하지 않습니다. 반면, 비선형 모델은 종종 기계적인, 즉 응답을 생성하는 메커니즘에 대한 모델을 기반으로합니다. 결과적으로 비선형 모델의 모델 매개 변수는 일반적으로 자연스럽게 해석됩니다. 경험적으로 도출 된 경우에도 비선형 모델은 일반적으로 무증상 및 단조 성과 같은 알려진 이론적 데이터 특성을 포함하며 이러한 경우 반 기계적 모델로 간주 될 수 있습니다. 비선형 모델은 일반적으로 다항식과 같은 경쟁사 선형 모델보다 적은 수의 매개 변수를 사용하므로 데이터에 대해보다 괄목 할만한 설명을 제공합니다. 비선형 모델은 또한 다항식 모델보다 관측 된 데이터 범위 밖의 응답 변수에 대해보다 안정적인 예측을 제공합니다. 데이터에 대해 좀 더 냉담한 설명을합니다. 비선형 모델은 또한 다항식 모델보다 관측 된 데이터 범위 밖의 응답 변수에 대해보다 안정적인 예측을 제공합니다. 데이터에 대해 좀 더 냉담한 설명을합니다. 비선형 모델은 또한 다항식 모델보다 관측 된 데이터 범위 밖의 응답 변수에 대해보다 안정적인 예측을 제공합니다.

선형성 문제를 넘어서는 nlme 패키지와 lme4 패키지에는 큰 차이가 있습니다. 예를 들어, nlme를 사용하면 선형 또는 비선형 모델에 적합 할 수 있으며, 두 유형 중 하나에 대해 그룹 내 오류 (예 : 자동 회귀)에 대한 분산 및 상관 구조를 지정할 수 있습니다. lme4는 그렇게 할 수 없습니다. 또한 임의의 효과는 어느 패키지에서든 고정되거나 교차 될 수 있지만 lme4에서 교차 된 임의 효과를 지정하고 모델링하는 것이 훨씬 쉽습니다.

먼저 a) 비선형 모델이 필요한지 여부와 b) 그룹 내 분산 또는 상관 구조를 지정해야하는지 고려하는 것이 좋습니다. 이 답변 중 하나라도 그렇다면 nlme를 사용해야합니다 (R을 고수하고 있음). 랜덤 효과를 교차하는 선형 모델 또는 중첩 및 교차 랜덤 효과의 복잡한 조합으로 많은 작업을 수행하는 경우 lme4가 더 나은 선택 일 수 있습니다. 두 패키지를 모두 사용하는 법을 배워야 할 수도 있습니다. lme4를 먼저 배운 다음 자동 회귀 오류 구조로 작업하기 때문에 nlme를 사용해야한다는 것을 깨달았습니다. 그러나 교차 요인이있는 실험의 데이터를 분석 할 때 여전히 lme4를 선호합니다. 좋은 소식은 lme4에 대해 배운 내용이 nlme에 잘 전달되었다는 것입니다. 어느 쪽이든

참고 문헌

Pinheiro, JC, & Bates, DM (2000). S 및 S-PLUS의 혼합 효과 모델 . 뉴욕 : Springer-Verlag.


이것은 훌륭한 반응입니다. 정교하게 감사합니다. 방금 오늘 그 책에 대한 또 다른 참고 자료를 찾았으며 이제 NLME가 필요하다는 것을 알았으므로 이제 그 책을 추적 할 것입니다.
Kevin

큰 반응! Pinheiro & Bates 스 니펫은 오늘 저녁 도서관에서 책을 가져갈 책이 있다고 확신했습니다.
theforestecologist

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