«r» 태그된 질문

/ 편집 : 추가 후속 조치 irlba :: prcomp_irlba를 사용할 수 있습니다 / 편집 : 내 자신의 게시물에 후속. irlba이제 "center"및 "scale"인수를 사용하여이를 사용하여 기본 구성 요소를 계산할 수 있습니다. 예 : pc <- M %*% irlba(M, nv=5, nu=0, center=colMeans(M), right_only=TRUE)$v Matrix기계 학습 알고리즘에 사용하려는 크고 작은 기능이 있습니다. library(Matrix) …

31 r  pca  dimensionality-reduction  svd  matrix-decomposition 

Trevor Hastie & Robert Tibshirani와 Jerome Friedman의 ElemStatLearn 책 "통계학 학습의 요소 : 데이터 마이닝, 추론 및 예측 2 판"에 설명 된 줄거리를 만들고 싶습니다. 줄거리는 다음과 같습니다 에서 정확한 그래프를 생성하는 방법이 궁금합니다 R. 특히 그리드 그래픽과 계산을 참고하여 경계를 표시하십시오.

31 r  data-visualization  k-nearest-neighbour 

BUGS와 R의 매개 변수가 Normal, log-Normal 및 Weibull 인 분포를 찾았습니다. 이들 각각에 대해, 나는 R이 사용하는 두 번째 매개 변수가 BUGS (또는 내 경우에는 JAGS)에서 사용되기 전에 역 변환 (1 / 매개 변수)이 필요하다는 것을 수집합니다. 현재 존재하는 이러한 변환의 포괄적 인 목록을 아는 사람이 있습니까? 내가 찾을 수있는 …

31 r  distributions  bugs  jags  parameterization 

주요 구성 요소 분석의 결과를 요약 테이블보다 더 많은 통찰력을 제공하는 방식으로 시각화 할 수 있습니까? ~ 1e4와 같이 관측 수가 많을 때 가능합니까? 그리고 R [다른 환경에서도 환영]에서 할 수 있습니까?

31 r  data-visualization  pca  biplot 

혼합 효과 모델을 사용하여 일부 데이터를 분석하려고합니다. 내가 수집 한 데이터는 시간이 지남에 따라 다른 유전자형의 일부 젊은 동물의 무게를 나타냅니다. 나는 여기에 제안 된 접근법을 사용하고 있습니다 : https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ 특히 솔루션 # 2를 사용하고 있습니다. 그래서 나는 같은 것을 가지고있다. require(nlme) model <- lme(weight ~ time * Genotype, random …

31 r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures 

상황 : 재현 가능한 연구에 대한 이전 질문에 대한 답으로 Jake는 JASA 아카이브를 작성할 때 발견 한 한 가지 문제점은 CRAN 패키지의 버전 및 기본값이 변경되었다는 것입니다. 따라서 해당 아카이브에는 사용한 패키지 버전도 포함됩니다. 사람들이 패키지를 변경하면 비 네트 기반 시스템이 작동하지 않을 수 있습니다 (패키지 내에 패키지 내에 추가 …

31 r  reproducible-research  project-management 

randomForestR의 분류 모델에 대한 변수 집합의 상대적인 중요성을 결정하고 싶습니다 .이 importance함수는 MeanDecreaseGini각 개별 예측 변수에 대한 메트릭을 제공합니다 . 집합의 각 예측 변수를 합산하는 것만 큼 간단합니까? 예를 들면 다음과 같습니다. # Assumes df has variables a1, a2, b1, b2, and outcome rf <- randomForest(outcome ~ ., data=df) importance(rf) …

31 r  machine-learning  classification  random-forest 

올가미 회귀 모형 및 매개 변수가 방정식에 부분적으로 만 입력되는 다른 정규화 된 모형에 대한 AIC 또는 BIC 값을 계산할 수 있습니까? 자유도를 어떻게 결정합니까? 패키지 의 glmnet()함수 에 올가미 회귀 모델을 맞추기 위해 R을 사용 glmnet하고 있으며 모델의 AIC 및 BIC 값을 계산하는 방법을 알고 싶습니다. 이런 식으로 정규화하지 …

31 r  model-selection  lasso  aic  bic 

수백만 개의 포인트가 존재할 때 R이 플롯을 생성하는 데 오랜 시간이 걸릴 수 있습니다. 포인트가 개별적으로 플롯 된 경우 놀랍지 않습니다. 또한, 그러한 음모는 종종 너무 복잡하고 조밀하여 유용하지 않습니다. 많은 점들이 겹치면서 검은 덩어리를 형성하며 많은 시간을 그 덩어리에 더 많은 점을 그리는 데 소비됩니다. 표준 산점도에서 큰 데이터 …

31 r  data-visualization 

나는 quasibinomial 분포가 무엇인지, 그리고 그것이 무엇인지에 대한 직관적 인 개요를 누군가가 제공 할 수 있기를 바랍니다. 특히 다음 사항에 관심이 있습니다. 유사 이항 분포가 이항 분포와 어떻게 다른가? 반응 변수가 비율 인 경우 (예 : 값에 0.23, 0.11, 0.78, 0.98 포함) 준이 항 모델은 R에서 실행되지만 이항 모델은 그렇지 …

30 r  generalized-linear-model  binomial  overdispersion  quasi-likelihood 

희망적으로 이것은 여기 누군가가 lmer( lme4 R 패키지에서) 혼합 효과 모델에서 제곱합을 분해하는 성질에 대해 대답 할 수있는 질문입니다 . 우선이 접근법을 사용하는 것에 대한 논쟁에 대해 알고 있다고 말하고 실제로 모델을 비교하기 위해 부트 스트랩 된 LRT를 사용할 가능성이 더 높습니다 (Faraway, 2006). 그러나 결과를 복제하는 방법에 의문이 생겼으므로 …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

바이 모달 분포의 중요성을 "테스트"하는 통계 테스트가 있는지 궁금합니다. 내 데이터가 바이 모달 분포를 얼마나 충족 시키는가? 그렇다면 R 프로그램에 테스트가 있습니까?

30 r  hypothesis-testing  distributions  bimodal 

이 두 기능의 현재 차이점에 대해 누군가가 나를 밝힐 수 있는지 궁금합니다. 다음 질문을 찾았습니다. 혼합 효과 모델에 대해 nlme 또는 lme4 R 라이브러리를 선택하는 방법은 무엇입니까? 하지만 몇 년 전부터 시작되었습니다. 그것은 소프트웨어 분야에서 평생입니다. 내 구체적인 질문은 다음과 같습니다 에 (여전히) 상관 관계 구조가 있습니까 lme그 lmer처리하지 않습니다는? …

30 r  mixed-model  lme4-nlme 

내가 R을 사용하고, 나는 구글에 검색하고 배운 kpss.test(), PP.test()그리고 adf.test()시계열의 정상 성에 대해 알고하는 데 사용됩니다. 그러나 나는 통계학자가 아니며 결과를 해석 할 수 있습니다 > PP.test(x) Phillips-Perron Unit Root Test data: x Dickey-Fuller = -30.649, Truncation lag parameter = 7, p-value = 0.01 > kpss.test(b$V1) KPSS Test for Level …

30 r  time-series  stationarity  augmented-dickey-fuller  kpss-test 

큰 데이터 집합이 있고 차원 축소를 수행하고 싶습니다. 이제 어디서나 PCA를 사용할 수 있다는 것을 읽었습니다. 그러나 여전히 PCA를 계산 / 수행 한 후해야 할 일을 찾지 못하는 것 같습니다. R에서는이 명령을 사용하여 쉽게 수행 할 수 있습니다 princomp. 그러나 PCA를 계산 한 후 어떻게해야합니까? 처음 주요 구성 요소 를 …

30 r  pca