«efficiency» 태그된 질문

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파이썬을위한 고품질 비선형 프로그래밍 솔버가 있습니까?
볼록하지 않은 전역 최적화 문제를 해결해야 할 몇 가지 문제가 있습니다. 현재 MATLAB의 Optimization Toolbox (특히 fmincon()algorithm = 사용 'sqp')를 사용하고 있습니다. 그러나 내 코드의 대부분은 Python이며 Python에서도 최적화를하고 싶습니다. 파이썬 바인딩과 경쟁 할 수있는 NLP 솔버가 fmincon()있습니까? 반드시 비선형 평등과 불평등 제약을 다룰 수있다 사용자가 Jacobian을 제공하도록 요구하지 않습니다. …

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의 계산 비용은
분자 시뮬레이션에서 다루어야 할 주요 문제 중 하나는 거리 의존적 힘의 계산입니다. 우리는 이격 거리의에도 힘을 가지고 힘과 거리의 기능을 제한 할 수있는 경우 , 우리는 거리의 제곱 계산할 수 있습니다 R 2 = R ⋅ 연구를 하고에 대해 걱정할 필요가 없습니다 R . 그러나 이상한 힘이 있다면 r = …
26 efficiency 

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입자 분해 및 도메인 분해 병렬화 알고리즘의 장단점은 무엇입니까?
Gromacs 및 DL_POLY와 같은 여러 소프트웨어 패키지를 사용하여 분자 역학 (MD) 시뮬레이션을 실행하고 있습니다. Gromacs는 이제 입자 분해 및 도메인 분해 알고리즘을 모두 지원합니다. Gromacs 시뮬레이션은 도메인 분해를 사용하지만, 최근까지 입자 분해가 Gromacs에서 구현 된 유일한 방법 임에도 불구하고 도메인 분해를 사용합니다. Gromacs 논문 중 하나 (DOI 10.1002 / jcc.20291)에서 …

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대용량 데이터 세트의 계산 문제에 대한 I / O 전략?
저의 연구 그룹은 분자 역학에 중점을 두었습니다. 분자 역학은 분명히 단일 궤도의 일부로 기가 바이트의 데이터를 생성하여 분석해야합니다. 우리가 우려하는 몇 가지 문제는 데이터 세트의 상관 관계와 관련이 있습니다. 즉, 순차적 인 접근 방식을 사용하지 않고 메모리에서 많은 양의 데이터를 추적하고 분석해야합니다. 내가 알고 싶은 것은 큰 데이터 세트의 I …
15 python  c  efficiency 

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Matlab에서 'for'루프를 작성하는 가장 효율적인 방법은 무엇입니까?
예를 들어 for행렬의 인덱스를 실행 하는 이중 루프가있는 경우 외부 루프에 열 실행 인덱스를 배치하는 것이 더 효율적 이라는 것을 읽었습니다 . 예를 들면 다음과 같습니다. a=zeros(1000); for j=1:1000 for i=1:1000 a(i,j)=1; end end for루프 가 세 개 이상인 경우 가장 효율적인 코딩 방법은 무엇입니까 ? 예를 들면 다음과 같습니다. …

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조회 비용과 계산
거리 기준이 충족되는지 확인하기 위해 계산을 설정하는 데 관심이 있습니다. 즉, 벡터 와 다른 벡터 x j 사이의 거리는 r m a x 값보다 작아야 합니다. 내 데이터는 직교 좌표 격자에 따라 분할됩니다. 내 컷오프가 가장 가까운 이웃 좌표의 끝점 사이의 거리보다 작기 때문에 일이 올바르게 설정되었는지 확인하기 위해 "octant"변수를 …
12 efficiency 

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자동 차별화는 언제 저렴합니까?
자동 미분을 통해 특정 입력에서 프로그램의 미분을 수치 적으로 평가할 수 있습니다. 이 계산은 원래 프로그램을 실행하는 비용의 5 배 미만의 비용으로 수행 될 수 있다는 이론이 있습니다. 이 5의 계수는 상한입니다. 어떤 상황에서이 비용을 더 줄일 수 있습니까? 대부분의 현장 파생 코드는 원래 프로그램의 속도와 거의 비슷하게 실행됩니다. 이 …

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사이 복잡성 있는가 및 [폐쇄]
닫은. 이 질문은 주제에 맞지 않습니다 . 현재 답변을받지 않습니다. 이 질문을 개선하고 싶습니까? Computational Science Stack Exchange에 대한 주제가 되도록 질문을 업데이트하십시오 . 휴일 오년 전에 . 보다 크고 보다 작은 복잡도가 있습니까?O(n)O(n)O(n)O(nlogn)O(nlog⁡n)O(n \log n)

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GPGPU 가속을위한 Nvidia K20X 및 GeForce Titan
학계 컴퓨팅, 특히 DGEMM 구성 요소에 대한 두 그래픽 카드의 차이점을 이해하려고 노력하고 있습니다. 원시 통계를 보면 둘 다 동일한 GK110 칩을 가지고 있으며 거의 ​​모든 범주에서 비슷한 통계를 가지고 있으며 동일한 코어 아키텍처를 가지고 있다고 생각합니다. 할인 전 K20X는 타이탄 비용의 약 4 배입니다. 효율성 측면에서 K20X보다 Titan을 사용하는 …

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불완전한 감마 기능의 빠르고 정확한 배정도 구현
배정도 특수 기능을 구현하는 최첨단 방법은 무엇입니까? 다음 적분이 필요합니다. 대m=0,1,2,. . . 및t>0, 이는 불완전한 감마 함수의 하에서 작성 될 수있다. 다음은 Fortran 및 C 구현입니다.에프미디엄( t ) = ∫10유2 M이자형− t u2디u = γ( m + 12, t )2 톤m + 12Fm(t)=∫01u2me−tu2du=γ(m+12,t)2tm+12 F_m(t) = \int_0^1 u^{2m} e^{-tu^2} d …
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