«lme4-nlme» 태그된 질문

에 다변량 (즉, 다중 응답) 혼합 모델을 맞추려고합니다 R. 이외에도에서 ASReml-r와 SabreR(외부 소프트웨어가 필요) 패키지,에서만 가능한 것 같다 MCMCglmm. 에서 용지 수반 MCMCglmm패키지 (pp.6)를 러드 Hadfield의 하나의 긴 포맷 변수에 복수 응답 변수를 재 형성하고 전체적인 절편을 억제하는 등의 그러한 모델을 피팅하는 과정을 설명한다. 인터셉트를 억제하면 응답 변수의 각 레벨에 …

10 r  mixed-model  multivariate-analysis  lme4-nlme  multivariate-regression 

나는 방금 Gelman의 이유를 읽었습니다 (우리는 일반적으로) 다중 비교에 대해 걱정할 필요가 없습니다 . 특히 "여러 결과 및 기타 과제" 섹션에서는 동일한 시간에 다른 사람 / 단위의 여러 관련 측정이있는 상황에 대해 계층 적 모델을 사용하는 방법에 대해 언급합니다. 바람직한 특성이 여러 개있는 것 같습니다. 나는 이것이 반드시 베이지안 일 …

10 multiple-comparisons  multilevel-analysis  lme4-nlme  jags  hierarchical-bayesian 

데이터 구조 > str(data) 'data.frame': 6138 obs. of 10 variables: $ RT : int 484 391 422 516 563 531 406 500 516 578 ... $ ASCORE : num 5.1 4 3.8 2.6 2.7 6.5 4.9 2.9 2.6 7.2 ... $ HSCORE : num 6 2.1 7.9 1 6.9 8.9 …

10 r  mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme 

두 가지 다른 시간 변수를 모델링하고 싶습니다. 일부 변수는 내 데이터에서 상당히 공 선적입니다 (나이 + 코호트 = 기간). 이렇게하면에 대한 몇 가지 문제와 lmer상호 작용이 발생 poly()했지만 IIRC lmer와 동일한 결과를 얻었을 것 nlme입니다. 분명히 poly () 함수의 기능에 대한 이해가 부족합니다. 나는 무엇을 이해하고 그것 poly(x,d,raw=T)없이는 raw=T직교 다항식 …

10 r  lme4-nlme  polynomial 

큰 데이터 세트에 대한 분석을 마무리하고 있습니다. 작업의 첫 번째 부분에 사용 된 선형 모델을 가져 와서 선형 혼합 모델 (LME)을 사용하여 다시 피팅하고 싶습니다. LME는 모델에 사용 된 변수 중 하나가 랜덤 효과로 사용된다는 점을 제외하면 매우 유사합니다. 이 데이터는 작은 주제 그룹 (~ 10)의 많은 관측치 (> 1000)에서 …

10 r  regression  hypothesis-testing  mixed-model  lme4-nlme 

이것은 개념적 질문이지만, 내가 사용할 R때의 패키지를 참조 할 것입니다 R. 목표가 예측 목적으로 선형 모형을 적합시킨 다음 임의 효과를 사용할 수없는 위치를 예측하는 경우 혼합 효과 모형을 사용하는 이점이 있습니까? 아니면 고정 효과 모형을 대신 사용해야합니까? 예를 들어, 다른 정보와 함께 체중 대 신장에 대한 데이터가 있고를 사용하여 다음 …

10 r  multiple-regression  mixed-model  lme4-nlme 

설계된 실험에서 시선 추적 데이터를 분석하고 있습니다. 이처럼 내 데이터 외모의 단순화 된 버전 (당신은 dput을 (받을 수) 데이터 여기 ) head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 9 Face 90 6 9 Plant 75 여기서 …

10 r  mixed-model  poisson-regression  lsmeans  lme4-nlme 

나는 주로 Bodo Winter의 훌륭한 자습서를 따라 lme4in을 사용하여 일부 행동 데이터를 분석하고 있지만 상호 작용을 올바르게 처리하고 있는지 이해할 수 없습니다. 더군다나,이 연구에 참여한 어느 누구도 혼합 모델을 사용하지 않기 때문에 문제가 옳다는 것을 확신 할 때 약간 표류합니다.R 도움을 요청하는 것보다는 문제를 해석하기 위해 최선을 다한 다음에 집단적인 …

10 r  mixed-model  p-value  lme4-nlme 

랜덤 효과에 대한 기본 분산 - 공분산 구조 란 glmer또는 lmer에서 lme4패키지는? 코드에서 랜덤 효과에 대한 다른 분산 공분산 구조를 어떻게 지정합니까? lme4설명서 에서 이에 관한 정보를 찾을 수 없습니다 .

10 mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

AIC를 사용하여 최상의 모델을 선택하여 혼합 모델 분석을 실행하는 방법에 대한 문헌을 찾으려고 노력한 후 압도적이라고 생각합니다. 내 데이터가 그렇게 복잡하다고 생각하지는 않지만 내가 한 일이 올바른지 확인한 다음 진행 방법에 대한 조언을 찾고 있습니다. REML 또는 ML을 사용해야하는 경우 lme 또는 lmer를 사용 해야하는지, 그중 하나를 사용 해야하는지 확실하지 …

10 r  lme4-nlme  random-effects-model  aic 

소개 두 가지 조건 ( E = 장갑 착용, B = 장갑 없음) 에서 대장균으로 오염 된 표면에 반복적으로 접촉하는 참가자가 있습니다 . 장갑의 유무에 관계없이 손가락 끝의 박테리아 양과 접촉 횟수 사이에 차이가 있는지 알고 싶습니다. 두 가지 요소 모두 참가자 내에 있습니다. 실험 방법 : 참가자 (n = …

9 r  anova  repeated-measures  lme4-nlme  glmm 

복잡한 최대 혼합 모형 (주어진 데이터 및 모형에 대해 가능한 모든 랜덤 효과를 추정)을 다룰 때 그리 드물지 않은 발생 은 일부 랜덤 효과 사이에 완벽하거나 (+1 또는 -1) 거의 완벽한 상관 관계입니다. 토론을 위해 다음 모델 및 모델 요약을 살펴 보겠습니다. Model: Y ~ X*Cond + (X*Cond|subj) # Y …

9 r  correlation  mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

GLMM의 사양 및 해석에 관한 몇 가지 질문이 있습니다. 3 가지 질문은 확실히 통계적이며 2 개는 R에 대해 더 구체적입니다. 궁극적으로 문제가 GLMM 결과의 해석이라고 생각하기 때문에 여기에 게시하고 있습니다. 현재 GLMM에 맞추려고합니다. Longitudinal Tract Database 의 미국 인구 조사 데이터를 사용하고 있습니다. 제 관찰은 인구 조사입니다. 저의 종속 변수는 …

9 r  lme4-nlme  poisson-distribution  negative-binomial  glmm 

시간이 지남에 따라 추세가 곡선으로 알려진 응용 프로그램에서 스플라인 항과 혼합 효과 모델을 피팅하고 있습니다. 그러나, 내가 평가하고 싶은 것은 선형성과의 개별 편차로 인해 곡선 선형 경향이 발생하는지 또는 그룹 레벨이 곡선 레벨로 나타나게하는 그룹 레벨에서의 영향입니다. JM 패키지의 데이터 세트를 지루한 재현 가능한 예제를 제공합니다. library(nlme) library(JM) data(pbc2) fitLME1 …

9 r  splines  lme4-nlme 

R의 lmer를 사용하여 cond일부 결과에 대한 조건 ( ) 의 영향을 확인하고 있습니다. 몇 가지 이루어져의 피사체 식별자 데이터 및 인 a, b및 c조건은 다음과 같다. library("tidyr") library("dplyr") set.seed(123) temp <- data.frame(s = paste0("S", 1:30), a = rnorm(30, -2, 1), b = rnorm(30, -3, 1), c = rnorm(30, -4, 1)) …

9 r  lme4-nlme  contrasts