«pymc» 태그된 질문

PyMC는 MCMC를 사용하여 베이지안 추론을 수행하기위한 Python 라이브러리입니다. JAGS 및 BUGS에 해당하는 Python입니다.

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예 : 이진 결과에 glmnet을 사용하는 LASSO 회귀
관심있는 결과가 이분법 인 LASSO Regressionglmnet 과 함께 사용하기 시작했습니다 . 아래에 작은 모의 데이터 프레임을 만들었습니다. age <- c(4, 8, 7, 12, 6, 9, 10, 14, 7) gender <- c(1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0) bmi_p <- c(0.86, 0.45, 0.99, 0.84, 0.85, 0.67, 0.91, 0.29, 0.88) …
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pymc를 이용한 베이지안 네트워크 추론 (초보자의 혼란)
현재 Coursera에서 Daphne Koller의 PGM 과정을 수강하고 있습니다. 여기에서 우리는 일반적으로 베이지안 네트워크를 관측 된 데이터의 일부인 변수의 원인 및 결과 지향 그래프로 모델링합니다. 그러나 PyMC 자습서 및 예제에서 나는 일반적으로 PGM과 같은 방식으로 모델링되지 않았거나 혼란 스럽습니다. PyMC에서 관측 된 실제 변수의 부모는 종종 변수를 모델링하는 데 사용하는 분포의 …

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기차 대기 시간의 베이지안 모델링 : 모델 정의
이것은 잦은 야영지에서 누군가 베이지안 데이터 분석을하기위한 첫 시도입니다. A. Gelman의 Bayesian Data Analysis에서 여러 자습서와 몇 개의 장을 읽었습니다. 내가 선택한 첫 번째 다소 독립적 인 데이터 분석 예제는 기차 대기 시간입니다. 나는 나 자신에게 물었다 : 대기 시간의 분포는 무엇인가? 데이터 세트는 블로그 에서 제공되었으며 PyMC 외부와 약간 …
12 bayesian  pymc 

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PyMC 초보자 : 실제로 적합 모델에서 샘플링하는 방법
나는 매우 간단한 모델을 시도하고 있습니다. 정밀도를 알고 있다고 가정하는 법선을 피팅하고 평균을 찾고 싶습니다. 아래 코드는 Normal에 올바르게 맞는 것 같습니다. 그러나 피팅 후 모델에서 샘플링하고 싶습니다. 예를 들어 data변수 와 유사한 새 데이터를 생성 합니다. trace("mean")평균 변수에 대한 샘플을 얻는 데 사용할 수 있다는 것을 알고 있습니다 . …
12 mcmc  pymc 

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PyMC3에서 베이지안 모델 선택
PyMC3을 사용하여 데이터에서 베이지안 모델을 실행하고 있습니다. 나는 Bayesian 모델링에 익숙하지 않지만 이 사이트의 일부 블로그 게시물 , Wikipedia 및 QA 에 따르면 Bayes factor 및 BIC 기준을 사용하여 내 데이터를 가장 잘 나타내는 모델을 선택할 수있는 유효한 접근 방법 인 것 같습니다 (생성하는 모델) 내 데이터). Bayes 계수를 계산하려면 …

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MCMC 샘플러에 Jeffrey 또는 엔트로피 기반 사전을 사용하는 것에 대한 권장 사항이있는 이유는 무엇입니까?
에 자신의 위키 페이지 , 스탠 상태의 개발자 : 우리가 싫어하는 일부 원칙 : 불변성, Jeffreys, 엔트로피 대신 많은 정규 배포 권장 사항이 있습니다. 지금까지 샘플링에 의존하지 않는 베이지안 방법을 사용했는데 왜 는 이항 우도에 적합합니다.θ∼Beta(α=12,β=12)θ∼Beta(α=12,β=12)\theta \sim \text{Beta}\left(\alpha=\frac{1}{2},\beta=\frac{1}{2}\right)
11 bayesian  mcmc  prior  pymc  stan 

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MCMC 및 PyMC를 사용한 2- 가우스 혼합 모델 추정
문제 간단한 2- 가우스 혼합 모집단의 모형 매개 변수를 적합하게 만들고 싶습니다. 베이지안 방법에 대한 과대 광고가 주어지면이 문제에 대해 베이지안 추론이 전통적인 피팅 방법보다 더 나은 도구인지 이해하고 싶습니다. 지금까지 MCMC는이 장난감 예제에서 성능이 좋지 않지만 아마도 간과했을 것입니다. 코드를 보자. 도구들 파이썬 (2.7) + scipy stack, lmfit 0.8 …

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비모수 적 군집화를위한 PyMC : 가우스 혼합의 매개 변수를 추정하기위한 Dirichlet 프로세스가 군집하지 못함
문제 설정 PyMC를 적용하려는 첫 번째 장난감 문제 중 하나는 비모수 적 군집입니다. 일부 데이터를 제공하고이를 가우스 혼합으로 모델링하고 군집 수와 각 군집의 평균 및 공분산을 배웁니다. 내가이 방법에 대해 알고있는 대부분의 내용은 2007 년경 Michael Jordan과 Yee Whye Teh의 비디오 강의 (스팀이 격렬 해지기 전에)와 Fonnesbeck 박사와 E. Chen의 …

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PyMC에서 두 개의 정규 분포에 대한 적합 모형
나는 시작하기 전에 더 많은 통계를 배우려고 노력하는 소프트웨어 엔지니어이기 때문에, 이것은 새로운 영역입니다. PyMC를 배우고 실제로 (실제로) 간단한 예제를 통해 작업했습니다. 내가 일할 수없는 한 가지 문제 (및 관련 예제를 찾을 수 없음)는 두 정규 분포에서 생성 된 데이터에 모델을 피팅하는 것입니다. 1000 개의 값이 있다고 가정합니다. a에서 생성 …
10 modeling  python  pymc 

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확률 적 프로그래밍을 통한 스위치 포인트 탐지 (pymc)
저는 현재 해커 "책"에 대한 확률 적 프로그래밍과 베이지안 방법을 읽고 있습니다. 몇 장을 읽었으며 pymc를 사용한 첫 번째 예제가 문자 메시지의 스위치 포인트를 감지하는 첫 번째 장에서 생각하고있었습니다. 이 예에서 전환점이 발생하는시기를 나타내는 임의 변수는 로 표시됩니다 . MCMC 단계 후 의 사후 분포 가 제공됩니다.ττ\tauττ\tau 우선이 그래프에서 배울 …
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