«lme4-nlme» 태그된 질문

닫은. 이 질문은 주제에 맞지 않습니다 . 현재 답변을받지 않습니다. 이 질문을 개선하고 싶습니까? 교차 검증에 대한 주제가 되도록 질문을 업데이트하십시오 . 휴일 7 개월 전 . R 패키지 nlme 및 lme4 에서 여러 랜덤 효과가있는 모델을 지정하려고했습니다. 나는 nlme 만이 분산의 이종 구조를 지정할 수 있음을 발견했습니다 . 따라서 …

25 r  random-effects-model  lme4-nlme 

ez패키지 사용에서 lme반복 측정 ANOVA 로 이동하려고합니다 (와 함께 사용자 정의 대비를 사용할 수 있기를 바랍니다 lme). 이 블로그 게시물 의 조언에 따라 aov( ez요청시 와 마찬가지로 ) 및을 사용하여 동일한 모델을 설정할 수있었습니다 lme. 그러나 그 게시물에 주어진 예 에서 F 값 은 ( aov와 lme내가 확인한 것) 사이에 …

24 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

@conjugateprior의 lm / lmer R 공식 개요를 살펴 보고 다음 항목으로 인해 혼란스러워했습니다. 이제 A는 무작위이지만 B는 고정되어 있고 B는 A 안에 중첩되어 있다고 가정합니다. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) 아래의 유사한 혼합 모델 공식 lmer(Y ~ B + (1 | A:B), data=d) 이 동일한 경우에 제공됩니다. 나는 그것이 …

23 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

혼합 모델에서 표본 크기를 계산하는 방법이 있는지 궁금합니다. lmerR에서 모델에 맞게 사용 하고 있습니다 (임의의 기울기와 요격이 있습니다).

23 r  mixed-model  lme4-nlme  power-analysis 

다음 구문을 사용하여 혼합 효과 로지스틱 회귀 분석을 실행했습니다. # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) 주제와 항목은 무작위 효과입니다. 주제 항에 대한 계수와 표준 편차가 모두 0 인 홀수 결과를 얻습니다. Generalized linear mixed …

22 r  mixed-model  stata  glmm  lme4-nlme 

각 사이트의 각 주제에 대해 약간의 측정이 있다고 가정합니다. 주제 및 사이트라는 두 가지 변수가 클래스 내 상관 (ICC) 값을 계산하는 데 관심이 있습니다. 일반적으로 lmerR package의 함수 를 사용 lme4하고 실행합니다. lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject) + (1 | site), mydata) ICC 값은 위 모델의 랜덤 효과에 …

22 r  lme4-nlme  intraclass-correlation 

종속 변수가 백분율 인 반복 측정 실험이 있고 독립 변수로 여러 요인이 있습니다. 이 설정을 직접 수용하는 것처럼 보이기 때문에 glmerR 패키지 를 사용 lme4하여 로지스틱 회귀 문제 (을 지정하여 family=binomial) 로 취급 하고 싶습니다 . 내 데이터는 다음과 같습니다 > head(data.xvsy) foldnum featureset noisered pooldur dpoolmode auc 1 0 …

21 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

다음 데이터 세트를 사용하여 사이트, 계절, 기간 및 상호 작용과 관련하여 응답 (효과)이 변경되는지 확인하고 싶었습니다. 통계에 관한 일부 온라인 포럼에서는 선형 혼합 효과 모델로 계속 진행할 것을 제안했지만 문제는 각 스테이션 내에서 복제가 무작위 화되므로 연속 시즌에 정확히 동일한 지점에서 샘플을 수집 할 기회가 거의 없다는 것입니다 (예 : …

21 r  mixed-model  lme4-nlme 

반복 측정에 문제가있는 일부 데이터로 작업하고 있습니다. 사이에 그렇게 나는 매우 다른 행동을 발견 lme()하고 lmer()내 테스트 데이터를 사용하는 이유를 알고 싶어합니다. 내가 만든 가짜 데이터 세트에는 10 명의 피험자에 대한 키와 체중 측정이 있으며 각각 두 번씩 측정됩니다. 나는 피험자들 사이에 키와 몸무게 사이에는 긍정적 인 관계가 있지만 각 …

20 r  mixed-model  lme4-nlme 

R의 lme4 패키지를 사용하여 혼합 효과 모델링을 살펴 보았습니다. 주로 lmer명령을 사용하고 있으므로 해당 구문을 사용하는 코드를 통해 질문을 제기합니다. 일반적인 쉬운 질문 일 수 있다고 생각합니다 lmer. 동일한 데이터 집합을 기반으로 가능성 비율 을 사용하여 구성된 두 모델을 비교해도 괜찮 습니까? 나는 그 대답이 "아니오"여야한다고 생각하지만, 틀릴 수 있습니다. …

20 r  mixed-model  lme4-nlme  likelihood-ratio 

쌍을 이루는 t- 검정 은 단방향 반복 측정 (또는 개체 내) 분산 분석과 선형 혼합 효과 모델의 특별한 경우이며 lme () 함수를 사용하여 R의 nlme 패키지 아래 그림과 같이. #response data from 10 subjects under two conditions x1<-rnorm(10) x2<-1+rnorm(10) # Now create a dataframe for lme myDat <- data.frame(c(x1,x2), c(rep("x1", …

20 r  mixed-model  t-test  repeated-measures  lme4-nlme 

과목 디자인 내에서 양방향으로 얻은 다음 데이터를 고려하십시오. df <- "http://personality-project.org/r/datasets/R.appendix4.data" df <- read.table(df,header=T) head(df) Observation Subject Task Valence Recall 1 1 Jim Free Neg 8 2 2 Jim Free Neu 9 3 3 Jim Free Pos 5 4 4 Jim Cued Neg 7 5 5 Jim Cued Neu 9 …

19 mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme  likelihood-ratio 

GLMM을해야한다고 mod1 <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) mod2 <- glmer(y ~ x + B + (1|g), data = dat) 이러한 모델은 일반적인 의미에서 중첩되지 않습니다. a <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) b <- glmer(y ~ x + A …

19 r  mixed-model  aic  lme4-nlme  nested-models 

시간이 지남에 따라 일부 카운트 데이터의 랜덤 효과 모델을 작업 중이고 일부 트렌드를 제어하려고한다고 가정합니다. 일반적으로 다음과 같은 작업을 수행합니다. lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") 에 대한 2 차 도형을 포함합니다 t. LOESS 스무더 또는 스플라인과 같은보다 정교한 스무딩 기술을 사용하여 해당 관계를 모델링 할 수 있습니까?

19 mixed-model  lme4-nlme  splines 

혼합 모델로 나를 혼란스럽게 만드는 차이점이 있으며, 명확성을 얻을 수 있는지 궁금합니다. 카운트 데이터의 혼합 모델이 있다고 가정 해 봅시다. 고정 효과 (A)와 시간 (T)에 대한 또 다른 변수로 원하는 변수가 있습니다 (예 : "사이트"변수). 내가 이해 한대로 : glmer(counts ~ A + T, data=data, family="Poisson") 고정 효과 모델입니다. glmer(counts …

19 r  mixed-model  lme4-nlme