«lme4-nlme» 태그된 질문

임의의 효과를 사용해야 할 때와 그것이 언제 필요한지 이해하려고합니다. 내가 경험 한 4 개 이상의 그룹 / 개인이 있다면 (15 개의 개별 무스) 경험에 근거한 경험이있다. 이 무스 중 일부는 총 29 회 시험을 위해 2 번 또는 3 번 실험되었습니다. 위험도가 높은 환경에있을 때와 다르게 작동하는지 알고 싶습니다. 그래서 …

34 mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model  glmm 

R을 사용하여 Poisson 분포 (과도 분산 포함)와 다중 수준 GLMM을 맞추고 싶습니다. 현재 lme4를 사용 하고 있지만 최근에 quasipoisson가족이 제거 되었음을 알았 습니다. 다른 곳에서는 관측 당 하나의 수준으로 임의의 절편을 추가하여 이항 분포에 대한 추가과 분산을 모델링 할 수 있음을 알았습니다. 포아송 분포에도 적용됩니까? 더 좋은 방법이 있습니까? 추천 …

32 r  mixed-model  poisson-distribution  lme4-nlme  overdispersion 

희망적으로 이것은 여기 누군가가 lmer( lme4 R 패키지에서) 혼합 효과 모델에서 제곱합을 분해하는 성질에 대해 대답 할 수있는 질문입니다 . 우선이 접근법을 사용하는 것에 대한 논쟁에 대해 알고 있다고 말하고 실제로 모델을 비교하기 위해 부트 스트랩 된 LRT를 사용할 가능성이 더 높습니다 (Faraway, 2006). 그러나 결과를 복제하는 방법에 의문이 생겼으므로 …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

이 두 기능의 현재 차이점에 대해 누군가가 나를 밝힐 수 있는지 궁금합니다. 다음 질문을 찾았습니다. 혼합 효과 모델에 대해 nlme 또는 lme4 R 라이브러리를 선택하는 방법은 무엇입니까? 하지만 몇 년 전부터 시작되었습니다. 그것은 소프트웨어 분야에서 평생입니다. 내 구체적인 질문은 다음과 같습니다 에 (여전히) 상관 관계 구조가 있습니까 lme그 lmer처리하지 않습니다는? …

30 r  mixed-model  lme4-nlme 

독립적 인 범주 형 변수 (여러 수준)의 p- 값과 효과 크기를 얻고 싶습니다. 즉, "전체"이며 각 수준에 대해 개별적으로는 아닙니다 ( lme4R 의 일반 출력 과 동일). 분산 분석을 실행할 때 사람들이보고하는 것. 어떻게 구할 수 있습니까?

28 r  hypothesis-testing  anova  mixed-model  lme4-nlme 

일반적인 합의 lmer()는 고전적인 분산 분석 대신 R에서 혼합 모델을 사용하는 것 같습니다 (불평형 설계, 교차 임의 효과 등 자주 인용되는 이유로), 나는 데이터를 사용 해보고 싶습니다. 그러나이 접근 방식을 관리자 (최종 p- 값으로 고전적인 분석을 기대하는 관리자) 또는 나중에 검토 자에게 "판매"할 수 있을지 걱정됩니다. 혼합 모델을 사용 lmer()하거나 …

27 r  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme  references 

다단계 모델에서 추정과 랜덤 효과 상관 모수의 추정과 비교의 실제적이고 해석과 관련된 의미는 무엇입니까? 이를 요청하는 실제적인 이유는 R의 lmer 프레임 워크에서 매개 변수 간의 상관 모델에서 추정이 수행 될 때 MCMC 기법을 통해 p- 값을 추정하는 방법이 없기 때문입니다. 예를 들어이 예제 (아래 인용 부분)를 보면 M2와 M3의 실제 …

27 r  mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model 

R에서 비선형 모델을 비교하기 위해 AIC (Akaike 's Information Criterion)를 사용하고 있습니다. 다른 유형의 모델의 AIC를 비교하는 것이 유효합니까? 구체적으로, glm에 맞는 모델과 glmer (lme4)에 맞는 랜덤 효과 항이있는 모델을 비교하고 있습니다. 그렇지 않은 경우 그러한 비교를 수행 할 수있는 방법이 있습니까? 아니면 아이디어가 완전히 유효하지 않습니까?

27 lme4-nlme  model-selection  aic 

문제 : [R]의 혼합 효과 {lme4} 모델에 사용할 수없는 다른 게시물 을 읽었습니다 .predictlmer 장난감 데이터 세트 로이 주제를 탐색하려고했습니다 ... 배경: 데이터 세트는 이 소스 에서 적용되며 다음과 같이 사용할 수 있습니다. require(gsheet) data <- read.csv(text = gsheet2text('https://docs.google.com/spreadsheets/d/1QgtDcGJebyfW7TJsB8n6rAmsyAnlz1xkT3RuPFICTdk/edit?usp=sharing', format ='csv')) 다음은 첫 번째 행과 헤더입니다. > head(data) Subject Auditorium …

27 r  mixed-model  lme4-nlme 

다음과 같은 출력이 있습니다. Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS2 +sAG2 +sSHDI2 +sbare +season +crop +(1|landscape) AIC BIC logLik deviance 4062 4093 -2022 4044 Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. landscape (Intercept) 0.82453 0.90804 Number of obs: 239, groups: landscape, 45 Fixed effects: …

26 mixed-model  poisson-distribution  lme4-nlme 

많은 도움말 사이트를 and이 뒤져서 혼합 모델에서 더 복잡한 중첩 용어를 지정하는 방법에 대해 여전히 혼란 스럽습니다. 또한의 사용으로 혼란 스러워요 :과 /와 |상호 작용을 지정하고 사용하여 임의 요소와 중첩에 lmer()에서 lme4의 패키지 R. 이 질문의 목적을 위해이 표준 통계 모델로 내 데이터를 정확하게 묘사했다고 가정합니다. 고정되고, 및 무작위입니다. 안에 …

26 r  mixed-model  lme4-nlme 

혼합 효과 모델링 분야의 리더로부터 아래 블록 인용문은 랜덤 효과 ( 'ZCP'모델) 간의 상관 관계가 0 인 모델의 좌표 이동이 모델 예측을 변경한다고 주장합니다. 그러나 누군가가 자신의 주장을 자세히 설명하거나 정당화 할 수 있습니까? 문제의 진술은 7 페이지, 두 번째 단락 ( 다운로드 링크 ) 에 대한 Bates et al의 …

25 r  mixed-model  lme4-nlme 

이 lmerTest패키지는 anova()선택적으로 Satterthwaite (기본값) 또는 Kenward-Roger의 자유도 (df) 근사값을 갖는 선형 혼합 모형에 대한 기능을 제공합니다 . 이 두 접근법의 차이점은 무엇입니까? 언제 선택해야합니까?

25 r  anova  mixed-model  lme4-nlme  degrees-of-freedom 

현재 혼합 효과 선형 모델을 사용하고 있습니다. R에서 "lme4"패키지를 사용하고 있습니다. 내 모델은 다음과 같은 형식을 취합니다. model <- lmer(response ~ predictor1 + predictor2 + (1 | random effect)) 모형을 실행하기 전에 예측 변수 간의 가능한 다중 공선 성을 확인했습니다. 나는 이것을함으로써 이것을했다 : 예측 변수의 데이터 프레임 만들기 dummy_df …

25 r  correlation  mixed-model  lme4-nlme  multicollinearity 

반복 된 디자인을 실행하여 세 가지 작업에서 30 명의 남성과 30 명의 여성을 테스트했습니다. 나는 남성과 여성의 행동이 어떻게 다른지 그리고 그것이 어떻게 과제에 달려 있는지 이해하고 싶습니다. 나는 이것을 조사하기 위해 lmer와 lme4 패키지를 모두 사용했지만 두 가지 방법에 대한 가정을 확인하려고 노력하고 있습니다. 내가 실행하는 코드는 lm.full <- …

25 r  mixed-model  assumptions  lme4-nlme