«mixed-model» 태그된 질문

퇴적 미생물 활동에 대한 건조의 영향을 평가하기 위해 데이터 세트를 작업 중입니다. 건조의 영향이 퇴적물 형태 및 / 또는 퇴적물 내 깊이에 따라 달라지는지를 결정하는 것이 목적입니다. 실험 설계는 다음과 같습니다. 첫 번째 요소 퇴적물 은 세 가지 유형의 퇴적물 (코드화 된 Sed1, Sed2, Sed3)에 해당합니다. 각 유형의 퇴적물에 대해, …

11 mixed-model  interaction  post-hoc  lme4-nlme 

최근에 이러한 공변량에 대한 시간 지연을 도입하지 않고 시간에 따른 공변량을 종 방향 혼합 모델에 통합 할 수 없다고 들었습니다. 이것을 확인 / 거부 할 수 있습니까? 이 상황에 대한 언급이 있습니까? 나는 명확히 할 간단한 상황을 제안한다. 40 명의 피험자에서 정량적 변수 (y, x1, x2, x3)의 측정 (30 회 …

11 r  mixed-model  lme4-nlme 

반복 측정 (2x2x2) lm과 lmer반복 측정 사이에 여러 상호 작용 테스트를 재현하려고합니다 . 두 방법을 비교하고 싶은 이유는 SPSS의 반복 측정에 대한 GLM이 lm여기에 제시된 방법 과 정확히 동일한 결과를 산출하기 때문에 결국 SPSS와 R-lmer를 비교하고 싶기 때문입니다. 지금까지 이러한 상호 작용 중 일부만 (근접 적으로) 재현했습니다. 내 요점을 더 …

10 anova  mixed-model  lme4-nlme  repeated-measures  lm 

손으로 선형 혼합 모델에서 랜덤 효과 예측을 계산하려고 시도하고 Generalized Additive Models 에서 Wood가 제공 한 표기법을 사용하여 R (pg 294 / pg 307 of pdf)을 사용하여 각 매개 변수에 대해 혼란스러워합니다. 나타냅니다. 아래는 Wood의 요약입니다. 선형 혼합 모형 정의 와이= Xβ+ Zb + ϵ와이=엑스β+지비+ϵ Y = X\beta + Zb …

10 mixed-model  lme4-nlme 

이 게시물에 대응하기 위해 연속 변수를 사용하여 데이터를 시뮬레이션하고 상관 된 절편과 기울기에 대출했습니다. 사이트 와 사이트 외부 에이 주제 에 대한 훌륭한 게시물이 있지만 간단한 실제 시나리오와 비슷한 시뮬레이션 된 데이터를 사용하여 처음부터 끝까지 예제를 작성하는 데 어려움이있었습니다. 따라서 문제는 이러한 데이터를 시뮬레이션하고로 "테스트"하는 방법입니다 lmer. 많은 사람들에게 새로운 …

10 regression  mixed-model  lme4-nlme 

에서 lmer내 기능 lme4에 R임의 효과의 모델 매트릭스 구성에 대한 요구가 같은 설명, 여기 , 페이지 7-9.ZZZ 계산 하는 것은 J_i 및 X_i 의 두 행렬의 KhatriRao 및 / 또는 Kronecker 곱을 수반 합니다. J i X iZZZJiJiJ_iXiXiX_i 행렬 JiJiJ_i 는 한 입 가득입니다. "그룹화 인자 지수의 지표 행렬"이지만 더 …

10 r  mixed-model  lme4-nlme  matrix 

R( lme4package) 의 선형 혼합 효과 모델에서 사후 테스트를 수행하고 있습니다. 내가 사용하고 multcomp패키지 ( glht()후 임시 테스트를 수행하는 기능). 내 실험 설계는 임의의 블록 효과로 반복 측정됩니다. 모델은 다음과 같이 지정됩니다. mymod <- lmer(variable ~ treatment * time + (1|block), data = mydata, REML = TRUE) 여기에 내 데이터를 …

10 mixed-model  post-hoc  lsmeans  lme4-nlme 

긍정적 인 연속적인 세 개의 변수 y와 범주 형인 세 개의 변수가 주어지면 다음 과 같은 두 가지 후보 모델이 있습니다.xz fit.me <- lmer( y ~ 1 + x + ( 1 + x | factor(z) ) ) 과 fit.fe <- lm( y ~ 1 + x ) 어떤 모델이 …

10 r  hypothesis-testing  mixed-model  lme4-nlme 

이 질문을하기 전에, 나는 우리 사이트를 검색하고 비슷한 질문을 많이 찾았습니다 ( 여기 , 여기 , 여기 ). 그러나 관련 질문에 대한 답변이나 토론이 제대로 이루어지지 않았다고 생각하여 다시 질문을 제기하고 싶습니다. 이런 종류의 질문에 대해보다 명확하게 설명하기를 원하는 많은 사람들이 있어야한다고 생각합니다. 제 질문은 제 선형 혼합 효과 모델을 …

10 mixed-model  residuals  heteroscedasticity  diagnostic 

참가자 ( ) 및 항목 ( )에 대한 교차 임의 효과가 m_plot적용된 다음 모델이 있습니다 .lme4::lmerlfdncontent Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. Corr lfdn (Intercept) 172.173 13.121 role1 62.351 7.896 0.03 inference1 24.640 4.964 0.08 -0.30 inference2 52.366 7.236 -0.05 0.17 -0.83 inference3 21.295 4.615 -0.03 0.22 0.86 -0.77 content …

10 mixed-model  lme4-nlme  intraclass-correlation 

R에서 반응 시간 실험 결과를 분석하고 있습니다. 반복 측정 ANOVA (2 수준의 개체 내 요인 1 및 2 수준의 개체 간 요인 1)를 반복해서 실행했습니다. 비슷한 선형 혼합 모델을 실행했으며를 사용하여 분산 분석 결과를 ANOVA 테이블 형식으로 요약하려고했습니다 lmerTest::anova. 나에게 잘못하지 마십시오 : 나는 동일한 결과를 기대하지 않았지만 결과의 자유도에 …

10 anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme  degrees-of-freedom 

혼합 모형에서는 랜덤 효과 (모수)가 정규 분포를 따르는 랜덤 변수라고 가정합니다. 모든 매개 변수가 무작위로 가정되는 베이지안 방법과 매우 유사합니다. 랜덤 효과 모델은 베이지안 방법의 특별한 경우입니까?

10 bayesian  mixed-model 

여러 스레드가 R-SIG는-ME 사용하여 예측에 대한 신뢰 구간을 구하는 방법에 대한 lme4및 nlme예를 들어 R.에서 여기 와 여기 Dougals 베이츠, 두 패키지의 저자 중 하나에 의해 약간의 해설을 포함하여, 2010 년. 나는 그들이 문맥에서 벗어나는 것에 대한 두려움 때문에 그에게 구두로 인용하는 것을 주저하지만 어쨌든 그가 한 의견은 "예측에서 매개 …

10 mixed-model 

나는 무작위 효과가 분산 (오류)에만 영향을 미치고 고정 효과는 평균에만 영향을 미친다는 것을 항상 배웠습니다. 그러나 랜덤 효과가 평균에 영향을 미치는 예-계수 추정치를 찾았습니다. require(nlme) set.seed(128) n <- 100 k <- 5 cat <- as.factor(rep(1:k, each = n)) cat_i <- 1:k # intercept per kategorie x <- rep(1:n, k) sigma …

10 r  mixed-model  random-effects-model 

혼합 효과 모델에서 범주 형 랜덤 효과의 효과가 랜덤 효과의 수준에 따라 관측치의 부분 풀링을 수행한다는 점을 이해합니다. 효과는 관측치 자체가 독립적이지 않고 부분 풀만 있다고 가정합니다. 또한 내 이해에 따르면, 같은 임의의 효과 수준을 공유하지만 고정 효과 수준이 다른 모형 관측치에서는 임의 효과와 고정 효과 수준이 다른 관측치보다 중요합니다. …

10 mixed-model  random-effects-model