«sequence-analysis» 태그된 질문

Shannon의 엔트로피 는 각 결과에 대한 확률의 로그에 곱한 각 결과의 확률의 합의 음수입니다. 이 방정식에서 대수는 어떤 목적으로 사용됩니까? 직관적이고 시각적 인 답변 (심층적 인 수학 답변과 반대)에는 보너스 포인트가 제공됩니다!

72 entropy  intuition  sequence-analysis 

음의 이항 분포는 생물 정보학에서 카운트 데이터 (특히 주어진 실험으로부터 게놈의 주어진 영역 내에서 예상되는 수의 서열 판독 횟수)에 대한 대중적인 모델이되었다. 설명은 다양합니다. 일부는 이것을 포아송 분포와 같이 작동하지만 추가 모수를 가지므로 평균과 반드시 ​​같지 않은 분산으로 실제 분포를 더 자유롭게 모델링 할 수 있습니다. 일부는 이것을 포아송 분포의 …

16 poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis 

GLMM 형식이 있습니다. lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) 를 사용할 때 자동차 패키지 또는에서 사용할 때 drop1(model, test="Chi")와 다른 결과를 얻습니다 . 후자의 두 사람도 같은 대답을합니다.Anova(model, type="III")summary(model) 조작 된 데이터를 사용 하여이 두 가지 방법이 일반적으로 다르지 않다는 것을 알았습니다. …

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상황 : 두 마리의 새 (수컷과 암컷)는 둥지에서 알을 침입자로부터 보호합니다. 각 새는 보호를 위해 공격이나 위협을 사용할 수 있으며 존재하거나 부재 할 수 있습니다. 행동은 상호 보완적일 수있는 데이터에서 나온 패턴이 있습니다. 내 질문은 : 어떻게 그러한 협력을 통계적으로 증명 하는가? 아니면 비슷한 분석을 다루는 행동 연구를 아는 사람이 …

10 r  sequence-analysis