«mixed-model» 태그된 질문

질문 개요 경고 :이 질문에는 많은 설정이 필요합니다. 저를 참아주세요. 저의 동료와 저는 실험 설계를하고 있습니다. 디자인은 많은 제약 조건을 해결해야하며, 아래에 나열합니다. 나는 제약 조건을 만족시키고 관심의 영향에 대한 편견없는 추정치를 제공하는 디자인을 개발했습니다. 그러나 저의 동료는 디자인에 혼란이 있다고 생각합니다. 우리는이 요점을 메스꺼움으로 해결하지 않고 논란을 일으켰으므로이 시점에서 …

12 mixed-model  experiment-design  simulation  confounding 

선형 혼합 효과 모델은 생물학 분야에서 일반적으로 사용되지 않으며, 작성하려는 논문에서 사용한 통계 테스트를보고해야합니다. 다중 수준 모델링에 대한 인식이 생명 과학의 일부 영역에서 나타나기 시작한다는 것을 알고 있습니다 ( 종속성에 대한 솔루션 : 중첩 된 데이터를 수용하기 위해 다중 수준 분석 사용 ) 결과를보고하는 방법을 배우려고 여전히 노력하고 있습니다! 내 …

12 mixed-model  repeated-measures  reporting 

나는 고독한 꿀벌 풍부도에 대해 매우 작은 데이터 세트를 가지고 있는데, 분석하는데 문제가 있습니다. 그것은 계수 데이터이며, 거의 모든 계수는 다른 처리에서 대부분의 0으로 처리됩니다. 6 개의 사이트 중 2 개에 각각 하나씩 두 개의 매우 높은 값이 있으므로 카운트 분포가 매우 긴 꼬리를 갖습니다. R에서 일하고 있습니다. lme4와 glmmADMB의 …

12 count-data  negative-binomial  mixed-model  zero-inflation  lme4-nlme 

함수 에 대한 일반화 된 비선형 최소 제곱 회귀에 대한 로그 우도를 계산하려고 합니다. ( 패키지 로부터) 브라운 운동을 가정하여 계통 발생 수 트리에서 거리에 의해 생성 된 분산 공분산 행렬을 사용하여 R 패키지의 함수 . 다음의 재현 가능한 R 코드는 x, y 데이터와 9 개의 분류법을 가진 임의의 트리를 …

12 r  maximum-likelihood  least-squares  nonlinear-regression  mixed-model 

데이터를 서로 연관 시켰으며 로지스틱 회귀 혼합 효과 모델을 사용하여 관심있는 예측 변수에 대한 개별 수준 (조건부) 효과를 추정합니다. 표준 한계 모델의 경우 Wald 검정을 사용한 모형 모수에 대한 추론이 우도 비율 및 점수 검정과 일치한다는 것을 알고 있습니다. 그들은 일반적으로 거의 동일합니다. Wald는 계산하기 쉽고 R 출력으로 제공되므로 99 …

12 logistic  mixed-model  inference 

패키지 의 함수 lmer()가 lme4p- 값을 생성하지 않았다는 인상을 받았습니다 ( lmerp- 값 및 그 밖의 모든 것을 참조하십시오 ). 이 질문에 따라 대신 MCMC에서 생성 된 p 값을 사용 했습니다. lme4혼합 모델의 중요한 효과 및이 질문 : 의 패키지에서 출력에서 p- 값을 찾을 수 없습니다lmer()lm4R . 최근에 memisc 라는 …

12 r  mixed-model  p-value  mcmc  lme4-nlme 

glmer비즈니스 데이터에 임의 효과 모델을 적용하고 있습니다. 목표는 지역별 변동을 고려하여 총판 별 판매 실적을 분석하는 것입니다. 다음과 같은 변수가 있습니다. distcode: 약 800 레벨의 총판 ID region: 최상위 지리 ID (북쪽, 남쪽, 동쪽, 서쪽) zone: 중간 수준 지리 내에 region약 30 개 수준이 중첩되어 있습니다. territory: zone약 150 단계 …

12 r  regression  mixed-model  lme4-nlme 

나는 다음과 같은 표기법에 익숙하다. 여기서β0J=β0+UJ및와이나는 j= β0+ β나는엑스나는 j+ u제이+ 전자나는 j= β0 j+ β나는엑스나는 j+ 전자나는 jyij=β0+βixij+uj+eij=β0j+βixij+eij\begin{align} y_{ij} &= \beta_0 + \beta_i x_{ij} + u_j + e_{ij}\\ &= \beta_{0j} + \beta_i x_{ij} + e_{ij} \end{align}β0 j= β0+ u제이β0j=β0+uj\beta_{0j}=\beta_{0}+u_j 여기서β0J=β0+U0J및β1J=β(1)+U(1)J와이나는 j= β0+ β1엑스나는 j+ u0 j+ u1 개 j엑스나는 …

12 mixed-model  mathematical-statistics 

반복 측정 설계를 위해 R에서 선형 회귀를 수행하는 방법을 알 수 없었습니다. A의 이전 질문 (아직 답) 그것은 사용하지 않는 나에게 제안 된 lm혼합 모델을 사용하지 않고 있지만. 나는 lm다음과 같은 방식으로 사용 했다 : lm.velocity_vs_Velocity_response <- lm(Velocity_response~Velocity*Subject, data=mydata) (데이터 세트에 대한 자세한 내용은 위의 링크에서 찾을 수 있습니다) 그러나 …

12 r  regression  mixed-model  repeated-measures 

MCMCglmm혼합 효과 모델을 실행하기 위해 R 의 패키지를 사용하는 성능 문제가 있습니다. 코드는 다음과 같습니다. MC1<-MCMCglmm(bull~1,random=~school,data=dt,family="categorical" , prior=list(R=list(V=1,fix=1), G=list(G1=list(V=1, nu=0))) , slice=T, nitt=iter, ,burnin=burn, verbose=F) 데이터에는 약 20,000 개의 관측치가 있으며 약 200 개의 학교에 모여 있습니다. 실행하기 전에 데이터 프레임에서 사용하지 않는 모든 변수를 삭제하고 메모리에서 다른 모든 개체를 …

12 r  mixed-model  mcmc  computational-statistics 

참고 :이 질문은 법적 이유로 인해 이전 질문을 삭제해야했기 때문에 다시 게시되었습니다. SAS의 PROC MIXED를 R lme의 nlme패키지 기능과 비교하는 동안 다소 혼란스러운 차이점을 발견했습니다. 구체적으로는, 다른 시험에서 자유도간에 상이 PROC MIXED하고 lme, 그리고 왜 생각해. 다음 데이터 세트에서 시작하십시오 (아래 제공된 R 코드). ind : 측정 대상을 나타내는 계수 …

12 r  mixed-model  sas  degrees-of-freedom  pdf  unbiased-estimator  distance-functions  functional-data-analysis  hellinger  time-series  outliers  c++  relative-risk  absolute-risk  rare-events  regression  t-test  multiple-regression  survival  teaching  multiple-regression  regression  self-study  t-distribution  machine-learning  recommender-system  self-study  binomial  standard-deviation  data-visualization  r  predictive-models  pearson-r  spearman-rho  r  regression  modeling  r  categorical-data  data-visualization  ggplot2  many-categories  machine-learning  cross-validation  weka  microarray  variance  sampling  monte-carlo  regression  cross-validation  model-selection  feature-selection  elastic-net  distance-functions  information-theory  r  regression  mixed-model  random-effects-model  fixed-effects-model  dataset  data-mining 

라이브러리 languageR은 lmer를 사용하여 혼합 효과 회귀 모형 적합에서 고정 효과의 MCMC 유의성 검정을 수행하는 방법 (pvals.fnc)을 제공합니다. 그러나 lmer 모델에 임의의 기울기가 포함되어 있으면 pvals.fnc에서 오류가 발생합니다. 이러한 모델에 대한 MCMC 가설 검정을 수행 할 수있는 방법이 있습니까? 그렇다면 어떻게? (응답을 받으려면 R에 실례가 있어야합니다.) 그렇지 않은 경우 개념적 …

12 r  mixed-model  statistical-significance  monte-carlo 

개별 올챙이의 "활동 수준"을 측정하는 비율로 구성된 데이터 집합이 있으므로 값을 0과 1 사이로 제한합니다.이 데이터는 개인이 특정 시간 간격 내에서 이동 한 횟수를 세어 수집했습니다 (이동, 0으로 이동 한 다음 평균을 계산하여 개인당 하나의 값을 만듭니다. 나의 주요 고정 효과는 "밀도 수준"입니다. 내가 겪고있는 문제는 임의의 효과로 포함하고 싶은 …

12 r  mixed-model  random-effects-model  beta-distribution  beta-regression 

누군가 혼합 모형과 선형 회귀 분석의 차이점을 설명해 주시겠습니까? (통계에 대한 지식이 매우 제한적입니다.)

12 regression  mixed-model 

반복 측정 데이터를 분석하려고 노력하고 R있습니다. 내 데이터는 본질적으로 다음과 같습니다. 두 개의 치료 그룹이 있습니다. 각 그룹의 모든 과목은 매일 시험을 치르며 점수 (시험에서 정확한 비율)를받습니다. 데이터는 긴 형식입니다. Time Percent Subject Group 1 0 GK11 Ethanol 2 0 GK11 Ethanol 3 0 GK11 Ethanol 4 0 GK11 Ethanol …

12 r  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme