«mixed-model» 태그된 질문

MCMCglmm최근 에 패키지를 사용하고 있습니다. 설명서에서 R 구조 및 G 구조라고하는 것에 혼동됩니다. 이는 임의의 영향과 관련이있는 것 같습니다. 특히 이전 분포에 대한 모수를 지정하지만 설명서의 설명은 독자가 이러한 용어가 무엇인지 알고 있다고 가정합니다. 예를 들면 다음과 같습니다. R (R- 구조) G (G- 구조) 및 B (고정 효과) : )는 …

16 r  bayesian  mixed-model  lme4-nlme 

통계 전문가와 R 프로그래밍 마법사 여러분, 안녕하세요. 환경 조건과 일의 함수로 동물 포획을 모델링하는 데 관심이 있습니다. 다른 연구의 일환으로, 3 년 동안 ~ 160 일 동안 포획 횟수가 많았습니다. 요즘에는 온도, 강우, 풍속, 상대 습도 등이 있습니다. 같은 5 플롯에서 데이터가 반복적으로 수집되었으므로 플롯을 임의의 효과로 사용합니다. 내 이해는 …

16 r  mixed-model  autocorrelation  bugs  panel-data 

선형 혼합 모형의 임의 효과에 대한 모형 선택에 대한 다양한 설명은 REML을 사용하도록 지시합니다. 일부 수준에서 REML과 ML의 차이점을 알고 있지만 ML이 바이어스되어 REML을 사용해야하는 이유를 이해하지 못합니다. 예를 들어 ML을 사용하여 정규 분포 모형의 분산 모수에 대해 LRT를 수행하는 것이 잘못 되었습니까 (아래 코드 참조)? 모델 선택에서 ML보다 편견이 …

16 mixed-model  maximum-likelihood  unbiased-estimator  likelihood-ratio  reml 

예측 변수 (P), 랜덤 효과 (R) 및 고정 효과 (F)가 주어지면 두 가지 혼합 효과 모델 ( lme4 구문)에 적합 할 수 있습니다 . m1 = lmer( P ~ (1|R) + F ) m2 = lmer( P ~ (1+F|R) + F) 내가 이해하는 것처럼 두 번째 모델은 고정 효과가 임의의 …

16 mixed-model 

모델이 있다고 가정 해 봅시다. mod <- Y ~ X*Condition + (X*Condition|subject) # Y = logit variable # X = continuous variable # Condition = values A and B, dummy coded; the design is repeated # so all participants go through both Conditions # subject = random effects for different …

16 mixed-model  lme4-nlme  overfitting  singular 

나는 무작위 효과 (피험자에 대한 BLUP / 조건 모드)가 선형 혼합 효과 모델의 매개 변수가 아니라 추정 분산 / 공분산 매개 변수에서 파생 될 수 있다는 것을 여러 번 읽었습니다. 예를 들어 Reinhold Kliegl et al. (2011) 상태 : 무작위 효과는 대 평균 RT에서 피사체의 편차와 고정 효과 매개 변수에서 …

15 mixed-model  intuition  blup 

내가 사용하려고 lme4::glmer()바이너리 아닌 종속 변수지만, 0과 1 사이의 연속 변수와 이항 일반화 된 혼합 모델 (GLMM)를 맞게. 이 변수를 확률로 생각할 수 있습니다. 사실 그것은 이다 사람을 대상으로하여 (실험하는 I 도움말 분석에)보고 된 확률. 즉 그건 아니 는 "이산"분수하지만, 연속 변수입니다. 내 glmer()(아래 참조) 예상대로 호출이 작동하지 않습니다. 왜? …

15 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

이력서 질문 혼합 효과 모델에 대해 (a) 상세하고 간결한 수학적 표현을 제공하려고합니다. lme4R 에서 패키지를 사용하고 있습니다. 모델에 올바른 수학 표현은 무엇입니까? 데이터, 과학 질문 및 R 코드 내 데이터 세트는 다른 지역의 종으로 구성됩니다. 종의 유병률이 멸종 (멸종이 반드시 영구적 일 필요는 없으며, 재 식민지화 될 수 있음)으로 이어 …

15 r  mixed-model  multilevel-analysis  lme4-nlme 

혼합 효과 모델에서는 모든 가능한 수준 (예 : 남성과 여성 모두)이 포함 된 경우 고정 효과를 사용하여 매개 변수를 추정하는 것이 좋습니다. 포함 된 수준이 모집단의 무작위 표본 (가능한 환자의 우주에서 등록 된 환자)이고 평균 대신 모집단 평균 및 분산을 추정하려는 경우 무작위 효과를 사용하여 변수를 설명하는 것이 좋습니다. 개별 …

15 mixed-model  random-effects-model  fixed-effects-model  many-categories 

순열 검정 (랜덤 화 검정, 재 랜덤 화 검정 또는 정확한 검정이라고도 함)은 매우 유용하며, 예를 들어 요구되는 정규 분포 가정이 t-test충족되지 않고 순위에 따라 값을 변환 할 때 유용합니다. 비모수 테스트 Mann-Whitney-U-test는 더 많은 정보가 손실 될 수 있습니다. 그러나 이러한 종류의 테스트를 사용할 때 단 하나의 가정 만 …

15 hypothesis-testing  permutation-test  exchangeability  r  statistical-significance  loess  data-visualization  normal-distribution  pdf  ggplot2  kernel-smoothing  probability  self-study  expected-value  normal-distribution  prior  correlation  time-series  regression  heteroscedasticity  estimation  estimators  fisher-information  data-visualization  repeated-measures  binary-data  panel-data  mathematical-statistics  coefficient-of-variation  normal-distribution  order-statistics  regression  machine-learning  one-class  probability  estimators  forecasting  prediction  validation  finance  measurement-error  variance  mean  spatial  monte-carlo  data-visualization  boxplot  sampling  uniform  chi-squared  goodness-of-fit  probability  mixture  theory  gaussian-mixture  regression  statistical-significance  p-value  bootstrap  regression  multicollinearity  correlation  r  poisson-distribution  survival  regression  categorical-data  ordinal-data  ordered-logit  regression  interaction  time-series  machine-learning  forecasting  cross-validation  binomial  multiple-comparisons  simulation  false-discovery-rate  r  clustering  frequency  wilcoxon-mann-whitney  wilcoxon-signed-rank  r  svm  t-test  missing-data  excel  r  numerical-integration  r  random-variable  lme4-nlme  mixed-model  weighted-regression  power-law  errors-in-variables  machine-learning  classification  entropy  information-theory  mutual-information 

혼합 모델에서 항상 겪었던 문제 중 하나는 결과를 얻은 후에는 종이나 포스터로 끝날 수있는 데이터 시각화를 파악하는 것입니다. 지금은 다음과 같은 공식을 사용하여 포아송 혼합 효과 모델을 작업 중입니다. a <- glmer(counts ~ X + Y + Time + (Y + Time | Site) + offset(log(people)) glm ()에 맞는 것을 …

15 r  data-visualization  mixed-model 

비선형 모델에서 그룹화 변수 사용에 관한 질문이 있습니다. nls () 함수는 요인 변수를 허용하지 않기 때문에 모형 적합에 대한 요인의 영향을 테스트 할 수 있는지 알아 내기 위해 고심하고 있습니다. 아래에는 "계절 화 된 폰 베르 탈란 피"성장 모델을 다양한 성장 처리 (가장 일반적으로 어류 성장에 적용)에 맞추려는 예가 포함되어 …

15 r  mixed-model  nls 

MEM (혼합 효과 모델)에 익숙하지만 동료가 최근에 LGM (잠재적 성장 모델)과 비교할 수있는 방법을 물었습니다. 나는 약간의 인터넷 검색을했으며 LGM은 적어도 하나의 임의 효과의 각 수준 내에서 반복 된 측정 값을 얻는 환경에 적용되는 구조 방정식 모델링의 변형 인 것처럼 보입니다. 따라서 Time은 모델에서 고정 효과가됩니다. 그렇지 않으면 MEM과 LGM은 …

15 mixed-model  panel-data 

여기서 추상화하려고하는 실험이 있습니다. 내가 당신 앞에 하얀 돌 3 개를 던지고 그들의 위치에 대한 판단을 요구한다고 상상해보십시오. 나는 돌의 다양한 속성과 당신의 응답을 기록합니다. 나는 여러 과목에 걸쳐 이것을한다. 두 가지 모델을 생성합니다. 하나는 가장 가까운 돌이 응답을 예측하고 다른 하나는 돌의 기하학적 중심이 응답을 예측한다는 것입니다. 따라서 RI에서 …

15 r  mixed-model  model-selection 

lmer (실제로 glmer)의 출력을 장난감 이항 예제와 일치시키고 싶습니다. 나는 삽화를 읽었고 무슨 일이 일어나고 있는지 이해한다고 믿는다. 그러나 분명히 나는하지 않습니다. 막힌 후, 나는 무작위 효과의 관점에서 "진실"을 고쳤으며, 고정 된 효과 만 추정 한 후에 갔다. 아래 에이 코드를 포함시킵니다. 그것이 합법적임을 알기 위해 주석을 달아 + Z …

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